54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0730 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0730  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 68 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00565405  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1292  TraR/DksA family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 67 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1463  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.690044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2758  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2085  transcriptional regulator, TraR/DksA family  58.7 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0832  hypothetical protein  48.33 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2704  hypothetical protein  47.83 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.422967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1292  hypothetical protein  58.33 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0645642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0566  hypothetical protein  43.08 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01805  hypothetical protein  67.74 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0973  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0176  hypothetical protein  57.5 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00392065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0920  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1738  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00500709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0889  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0952  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0374  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1167  hypothetical protein  44.26 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1862  hypothetical protein  48.98 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00332482  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01750  hypothetical protein  61.29 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4228  hypothetical protein  51.22 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312261 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2787  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116228  normal  0.0228649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5590  hypothetical protein  53.66 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64410  hypothetical protein  53.66 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0916  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  46.27 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000414298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0871  hypothetical protein  45.65 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2549  hypothetical protein  45.65 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1480  hypothetical protein  66.67 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0124  hypothetical protein  51.22 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0478  phage TraR/DksA family protein  40 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.1711  normal  0.241622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1685  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.27 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.554769  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2839  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.65 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0952  hypothetical protein  45.65 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2541  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00770  hypothetical protein  45.65 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2983  hypothetical protein  43.75 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000187823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0690  hypothetical protein  53.66 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0858  hypothetical protein  45.65 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1690  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0827  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00787  hypothetical protein  45.65 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2840  hypothetical protein  45.65 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0861  hypothetical protein  47.5 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0133  hypothetical protein  51.22 
 
 		 88 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1359  transcriptional regulator, TraR/DksA family  58.82 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1233  hypothetical protein  61.29 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0875  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0418872  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0268  hypothetical protein  59.26 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05034  DnaK suppressor protein  54.84 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1494  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.68 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1833  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.91 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0609  transcriptional regulator, TraR/DksA family  58.82 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3428  hypothetical protein  51.22 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0030  conjugal transfer protein TraR  53.12 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>