33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1292 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1292  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 67 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0730  TraR/DksA family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 68 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00565405  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1463  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.690044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2758  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01805  hypothetical protein  64.71 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0124  hypothetical protein  54.35 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0478  phage TraR/DksA family protein  40.91 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.1711  normal  0.241622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3162  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.78 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2787  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116228  normal  0.0228649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1685  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.62 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.554769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1494  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.62 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0916  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  44.62 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000414298  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0566  hypothetical protein  43.33 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0176  hypothetical protein  53.85 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00392065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2704  hypothetical protein  43.08 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.422967  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0133  hypothetical protein  52.17 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05034  DnaK suppressor protein  57.14 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0832  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3037  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  38.1 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0965532  normal  0.257312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4228  hypothetical protein  53.85 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1167  hypothetical protein  44.62 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0030  conjugal transfer protein TraR  43.48 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01750  hypothetical protein  51.43 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0609  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.88 
 
 		 79 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5061  hypothetical protein  52.5 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0899139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0695  hypothetical protein  52.5 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0875  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0418872  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1738  hypothetical protein  42.22 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00500709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1833  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.72 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1690  hypothetical protein  51.28 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2541  hypothetical protein  51.28 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1036  probable rRNA transcription initiatior protein,putative phage gene  48.57 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2983  hypothetical protein  60 
 
 		 88 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000187823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>