32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0695 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5061  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0899139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0695  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2705  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.26 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00476822  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0478  phage TraR/DksA family protein  45.07 
 
 
66 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.1711  normal  0.241622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0951  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.748618  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0176  hypothetical protein  60 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00392065  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1738  hypothetical protein  45.16 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00500709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1494  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.66 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2120  hypothetical protein  56.1 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.40904  normal  0.833846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1685  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.25 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.554769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1167  hypothetical protein  54.76 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3778  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.16 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.563726  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2085  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.71 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2541  hypothetical protein  49.02 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2704  hypothetical protein  53.85 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.422967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1690  hypothetical protein  49.02 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1677  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.66 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5590  hypothetical protein  53.85 
 
 
88 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05034  DnaK suppressor protein  43.06 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64410  hypothetical protein  53.85 
 
 
88 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1048  hypothetical protein  38.81 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0566  hypothetical protein  51.16 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118143 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0832  hypothetical protein  58.82 
 
 
88 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1292  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.5 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1359  transcriptional regulator, TraR/DksA family  58.54 
 
 
88 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0124  hypothetical protein  47.62 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0690  hypothetical protein  51.28 
 
 
88 aa  40.8  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1833  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.43 
 
 
74 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0133  hypothetical protein  47.62 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1480  hypothetical protein  54.05 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2519  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.36 
 
 
73 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0666  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 
73 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>