12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1048 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1048  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  144  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1036  probable rRNA transcription initiatior protein,putative phage gene  50.79 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05034  DnaK suppressor protein  49.25 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1463  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.690044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2758  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.421806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00488  conserved hypothetical protein  37.1 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2881  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000120273  normal  0.0538694 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00494  hypothetical protein  37.1 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0695  hypothetical protein  38.81 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5061  hypothetical protein  38.81 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0899139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0801  phage/conjugal plasmid C-4 type zinc finger protein  37.88 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.500339  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1862  hypothetical protein  32.31 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00332482  normal  0.539982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>