26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1036 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1036  probable rRNA transcription initiatior protein,putative phage gene  100 
 
 		 71 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1048  hypothetical protein  50.79 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05034  DnaK suppressor protein  49.28 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3059  DksA/TraR family protein  44 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.386172  normal  0.996544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2877  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  44 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0916  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  40 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000414298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2787  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116228  normal  0.0228649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0133  hypothetical protein  67.74 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1677  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1348  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0302261  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0756  hypothetical protein  41.94 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0374591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0374  hypothetical protein  34.33 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3162  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0951  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.748618  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2519  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1690  hypothetical protein  60 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1233  hypothetical protein  54.29 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3037  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  44.74 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0965532  normal  0.257312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2541  hypothetical protein  65.38 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2704  hypothetical protein  43.75 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.422967  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0124  hypothetical protein  61.29 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2085  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.04 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01750  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3419  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  40.62 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00386497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1292  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2675  hypothetical protein  48.57 
 
 		 88 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>