25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0801 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0801  phage/conjugal plasmid C-4 type zinc finger protein  100 
 
 		 73 aa  147  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.500339  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2881  TraR/DksA family transcriptional regulator  98.63 
 
 		 73 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000120273  normal  0.0538694 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00488  conserved hypothetical protein  90.14 
 
 		 72 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00494  hypothetical protein  90.14 
 
 		 72 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05034  DnaK suppressor protein  41.67 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0666  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.24 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2675  hypothetical protein  49.06 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3183  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.14 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.775887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1463  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.690044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01805  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1233  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2758  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 68 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1685  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.92 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.554769  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1959  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.29 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3778  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.563726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0124  hypothetical protein  42.37 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01750  hypothetical protein  45.31 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1048  hypothetical protein  37.88 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3037  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  37.5 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0965532  normal  0.257312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1677  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 78 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0566  hypothetical protein  32.31 
 
 		 89 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118143 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1494  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.38 
 
 		 69 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2787  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116228  normal  0.0228649 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3840  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0916  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  34.78 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000414298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>