61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_07970 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_07970  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  2.71217e-16  hitchhiker  0.000634076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0756  hypothetical protein  87.88 
 
 		 66 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0374591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3419  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  52.86 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00386497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3037  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.48 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0965532  normal  0.257312 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2675  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05034  DnaK suppressor protein  42.03 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1833  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.94 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3980  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000000420347  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0920  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0973  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0875  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0418872  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1292  hypothetical protein  41.94 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0645642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0889  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0858  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0871  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2840  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1862  hypothetical protein  62.16 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00332482  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0952  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00787  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00770  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2839  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.43 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1233  hypothetical protein  46 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0827  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2549  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1359  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0952  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0861  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0133  hypothetical protein  48.98 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0124  hypothetical protein  48.98 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1463  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.690044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0268  hypothetical protein  55.56 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3012  hypothetical protein  56.76 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0800466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4228  hypothetical protein  42 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2397  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5590  hypothetical protein  46.94 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64410  hypothetical protein  46.94 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0666  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1685  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.81 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.554769  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0030  conjugal transfer protein TraR  53.12 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2758  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0478  phage TraR/DksA family protein  40.91 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.1711  normal  0.241622 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2120  hypothetical protein  52.27 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.40904  normal  0.833846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0832  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1494  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.81 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2085  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.71 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0374  hypothetical protein  42 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01750  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1738  hypothetical protein  52.27 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00500709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2704  hypothetical protein  48 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.422967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3053  DnaK suppressor protein  44.83 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0690  hypothetical protein  44.9 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1690  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2541  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3778  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.563726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.12 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1480  hypothetical protein  42 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2705  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00476822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  58.06 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1959  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.18 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3428  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>