More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0920 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  100 
 
 
518 aa  1054    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  57.26 
 
 
500 aa  588  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  55.62 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  55.93 
 
 
496 aa  567  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  53.65 
 
 
511 aa  561  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  55.91 
 
 
504 aa  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  53.07 
 
 
501 aa  559  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  53.91 
 
 
502 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  55.21 
 
 
506 aa  557  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  53.54 
 
 
515 aa  548  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  53.88 
 
 
512 aa  551  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  54.55 
 
 
498 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  52.76 
 
 
509 aa  544  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  53.61 
 
 
511 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  54.56 
 
 
499 aa  522  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  46.64 
 
 
509 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  48.89 
 
 
505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  43.68 
 
 
499 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  44.44 
 
 
489 aa  433  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  46.06 
 
 
511 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  45.33 
 
 
517 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  45.33 
 
 
517 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  41.78 
 
 
500 aa  422  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  41.43 
 
 
492 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  41.43 
 
 
492 aa  419  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  42.23 
 
 
484 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  40.12 
 
 
488 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  40 
 
 
503 aa  390  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  41.92 
 
 
483 aa  388  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  39.76 
 
 
496 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  41.48 
 
 
484 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  40.63 
 
 
494 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  43.82 
 
 
490 aa  382  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  41.19 
 
 
496 aa  382  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  42.24 
 
 
493 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  42.66 
 
 
484 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  41.04 
 
 
493 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  42.54 
 
 
485 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  42.06 
 
 
484 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  42.26 
 
 
484 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  44.89 
 
 
499 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  42.06 
 
 
484 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  40.64 
 
 
492 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  42.06 
 
 
484 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  42.26 
 
 
484 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  41.87 
 
 
484 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  40.8 
 
 
484 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  43.8 
 
 
482 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  40.8 
 
 
484 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  42.09 
 
 
484 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  40.88 
 
 
489 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  40.56 
 
 
486 aa  371  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  41.87 
 
 
484 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  40.94 
 
 
494 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  40.84 
 
 
493 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  40.8 
 
 
484 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  40.24 
 
 
493 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  40.64 
 
 
493 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  40.6 
 
 
484 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  40.95 
 
 
485 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  40.44 
 
 
493 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  40.44 
 
 
493 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  40.44 
 
 
493 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  41.33 
 
 
486 aa  363  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  41.26 
 
 
493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  40.95 
 
 
485 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  39.88 
 
 
484 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  40.95 
 
 
491 aa  361  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  40.24 
 
 
486 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  39.88 
 
 
487 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  39.72 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  40.28 
 
 
483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  40.2 
 
 
483 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  40.12 
 
 
483 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  42.57 
 
 
492 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  42.57 
 
 
492 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  40.94 
 
 
487 aa  353  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  39.21 
 
 
484 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  42.57 
 
 
492 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  39.08 
 
 
484 aa  353  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  40.68 
 
 
484 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  40 
 
 
495 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  41.98 
 
 
492 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  41.78 
 
 
492 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  39.04 
 
 
484 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  39.04 
 
 
484 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  38.6 
 
 
496 aa  347  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  39.01 
 
 
488 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  39.28 
 
 
486 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  41.75 
 
 
486 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  41.51 
 
 
486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  36.17 
 
 
503 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  41.51 
 
 
486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  38.07 
 
 
481 aa  340  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  41.51 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  41.51 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  41.51 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  40.58 
 
 
508 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  41.51 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  38.61 
 
 
480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>