More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3364 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  100 
 
 
304 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  61.44 
 
 
311 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  62.62 
 
 
318 aa  359  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  64.14 
 
 
309 aa  358  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  63.49 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  61.64 
 
 
310 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  59.74 
 
 
308 aa  351  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  61.97 
 
 
309 aa  348  7e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  60.53 
 
 
308 aa  348  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  57.7 
 
 
311 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  59.93 
 
 
310 aa  345  7e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  60.78 
 
 
310 aa  343  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  60.78 
 
 
311 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  58.61 
 
 
311 aa  340  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  61.11 
 
 
317 aa  340  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  63.61 
 
 
309 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  60.91 
 
 
309 aa  338  8e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  58.69 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  58.88 
 
 
308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  58.69 
 
 
309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  58.77 
 
 
320 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  58.82 
 
 
317 aa  334  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  59.61 
 
 
309 aa  334  1e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  54.1 
 
 
304 aa  334  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  57.76 
 
 
309 aa  333  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  59.02 
 
 
310 aa  332  4e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  57.84 
 
 
311 aa  332  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  60.91 
 
 
309 aa  330  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  56.25 
 
 
312 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  60 
 
 
309 aa  329  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  56.58 
 
 
311 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  57.33 
 
 
320 aa  328  8e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  58.36 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  56.82 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  58.17 
 
 
317 aa  326  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  57.7 
 
 
309 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  55.59 
 
 
312 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  58.03 
 
 
309 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  56.49 
 
 
320 aa  324  9e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  58.03 
 
 
308 aa  324  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  59.8 
 
 
327 aa  324  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  57.7 
 
 
310 aa  323  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  56.67 
 
 
320 aa  323  2e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  58.55 
 
 
308 aa  323  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  59.67 
 
 
308 aa  323  3e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  55.59 
 
 
311 aa  322  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  56.17 
 
 
320 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  60.33 
 
 
309 aa  322  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  57.38 
 
 
309 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  55.52 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  56.49 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  61.36 
 
 
306 aa  319  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.13 
 
 
310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.13 
 
 
310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  55.81 
 
 
320 aa  318  6e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  60.32 
 
 
306 aa  318  6e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  53.8 
 
 
310 aa  318  7e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  59.67 
 
 
314 aa  318  7e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  55.74 
 
 
310 aa  317  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  58.61 
 
 
307 aa  316  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  55.74 
 
 
309 aa  316  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  55 
 
 
309 aa  315  6e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  55 
 
 
316 aa  315  7e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  56.72 
 
 
308 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  57.79 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  56.86 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  54.55 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  54.15 
 
 
304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  56.49 
 
 
322 aa  312  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  56.72 
 
 
308 aa  312  4.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  56.17 
 
 
309 aa  312  4.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  56.07 
 
 
311 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  57.05 
 
 
311 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  59.93 
 
 
307 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  52.13 
 
 
307 aa  310  1e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  58.28 
 
 
307 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  55.74 
 
 
311 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  54.93 
 
 
311 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  50.82 
 
 
304 aa  309  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  57.52 
 
 
323 aa  308  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  57.52 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  52.79 
 
 
307 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  55.26 
 
 
311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  57.19 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  53.27 
 
 
310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  56.39 
 
 
309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  57 
 
 
322 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  54.52 
 
 
316 aa  306  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  54.28 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  54.87 
 
 
322 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  54.05 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  55.52 
 
 
321 aa  301  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  55.08 
 
 
309 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  53.77 
 
 
308 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  54.43 
 
 
307 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  53.9 
 
 
309 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  57 
 
 
323 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  52.96 
 
 
311 aa  299  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  54.58 
 
 
328 aa  299  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  57.79 
 
 
334 aa  298  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>