26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2140 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  100 
 
 
153 aa  309  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  33.57 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  35.57 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  33.8 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  29.49 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  34 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  34.9 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  29.53 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  29.41 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  29.53 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  24.49 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  24.49 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  27.85 
 
 
171 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  26.17 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  28.1 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  25.5 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  28.77 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  24.83 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  26.97 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  26.39 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  28.78 
 
 
284 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  24.18 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  28.83 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  23.91 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  24.16 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  29.66 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>