More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3021 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0776  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.19 
 
 		 481 aa  634    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.141721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3021  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 485 aa  971    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143518  normal  0.755617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  64.9 
 
 		 490 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  64.27 
 
 		 497 aa  624  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  63.64 
 
 		 497 aa  617  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  65.33 
 
 		 479 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  65.33 
 
 		 479 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  63.64 
 
 		 479 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  65.75 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  65.54 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  65.54 
 
 		 479 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  61.3 
 
 		 477 aa  569  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  65.54 
 
 		 479 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2328  aldehyde dehydrogenase  65.54 
 
 		 479 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2463  aldehyde dehydrogenase  65.54 
 
 		 479 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.32545  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  65.54 
 
 		 479 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1077  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  65.12 
 
 		 479 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2278  aldehyde dehydrogenase family protein  64.9 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0735  aldehyde dehydrogenase family protein  64.9 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  64.9 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1235  aldehyde dehydrogenase family protein  64.9 
 
 		 479 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1591  aldehyde dehydrogenase family protein  64.9 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  64.9 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2290  aldehyde dehydrogenase  59.78 
 
 		 486 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  62.09 
 
 		 478 aa  552  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  61.87 
 
 		 478 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0874  aldehyde dehydrogenase  65.33 
 
 		 479 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  61.22 
 
 		 478 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  61.22 
 
 		 478 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  60.57 
 
 		 478 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  59.41 
 
 		 477 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  59.2 
 
 		 477 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2664  aldehyde dehydrogenase  60.65 
 
 		 480 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0216707  normal  0.214781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4882  aldehyde dehydrogenase  61.09 
 
 		 477 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.895119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1254  aldehyde dehydrogenase  58.4 
 
 		 481 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.69 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3004  aldehyde dehydrogenase  59.35 
 
 		 477 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1430  aldehyde dehydrogenase  58.04 
 
 		 487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  56.25 
 
 		 482 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  56.25 
 
 		 482 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4949  aldehyde dehydrogenase  53.81 
 
 		 477 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0091  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.84 
 
 		 482 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1251  Aldehyde Dehydrogenase  58.35 
 
 		 480 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1357  aldehyde dehydrogenase  54.43 
 
 		 487 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1974  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  54.43 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1691  aldehyde dehydrogenase  57.61 
 
 		 478 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0928  aldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 		 494 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.98 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.16 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  43.76 
 
 		 485 aa  358  9.999999999999999e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  39.54 
 
 		 491 aa  337  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0847  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 		 494 aa  335  7e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00938434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.68 
 
 		 508 aa  332  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 498 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 		 493 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  38.98 
 
 		 493 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.14 
 
 		 483 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  41.48 
 
 		 497 aa  330  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  41.96 
 
 		 483 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  44.79 
 
 		 492 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.19 
 
 		 493 aa  329  7e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  39.7 
 
 		 473 aa  329  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  38.98 
 
 		 493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7306  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.19 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.4 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3102  aldehyde dehydrogenase  42.41 
 
 		 502 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  40.08 
 
 		 492 aa  326  5e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.91 
 
 		 503 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  38.77 
 
 		 493 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.77 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  41.23 
 
 		 478 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  38.56 
 
 		 493 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.93 
 
 		 496 aa  323  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 		 493 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0443  aldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 		 477 aa  323  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.451373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.49 
 
 		 493 aa  323  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  40.47 
 
 		 483 aa  323  6e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.3 
 
 		 494 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  40.61 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5372  aldehyde dehydrogenase family protein  40.76 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302622  normal  0.199595 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  39.3 
 
 		 494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.64 
 
 		 498 aa  320  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  40.26 
 
 		 490 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.08 
 
 		 494 aa  319  7e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 512 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 		 483 aa  319  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6251  aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 		 487 aa  319  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.88 
 
 		 496 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  37.89 
 
 		 508 aa  317  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>