More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0274 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  81.31 
 
 		 396 aa  663    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  90.79 
 
 		 391 aa  728    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  80.56 
 
 		 396 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  80.56 
 
 		 396 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  77.78 
 
 		 396 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  77.78 
 
 		 396 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  77.94 
 
 		 399 aa  637    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  88.46 
 
 		 391 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_004310  BR1235  elongation factor Tu  82.61 
 
 		 391 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0193734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1251  elongation factor Tu  82.61 
 
 		 391 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.299738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  78.43 
 
 		 396 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0984  elongation factor Tu  84.91 
 
 		 391 aa  658    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0503391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  78.34 
 
 		 397 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  634    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  88.46 
 
 		 391 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  88.46 
 
 		 391 aa  716    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1940  elongation factor Tu  82.35 
 
 		 391 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0696  elongation factor Tu  84.14 
 
 		 391 aa  650    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628191  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  640    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1954  elongation factor Tu  82.35 
 
 		 391 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  81.06 
 
 		 396 aa  658    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1315  elongation factor Tu  83.38 
 
 		 391 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  82.49 
 
 		 396 aa  667    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  90.79 
 
 		 391 aa  728    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  88.46 
 
 		 391 aa  715    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  88.46 
 
 		 391 aa  715    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  79.95 
 
 		 396 aa  648    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0563  elongation factor Tu  83.89 
 
 		 391 aa  646    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000014358  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1812  elongation factor Tu  83.38 
 
 		 391 aa  648    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1837  elongation factor Tu  83.38 
 
 		 391 aa  648    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2690  elongation factor Tu  80.56 
 
 		 396 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.534989  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2702  elongation factor Tu  80.56 
 
 		 396 aa  635    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0762805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1198  elongation factor Tu  82.61 
 
 		 391 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1213  elongation factor Tu  82.61 
 
 		 391 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  81.31 
 
 		 396 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  81.31 
 
 		 396 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 396 aa  634    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0555  elongation factor Tu  93.09 
 
 		 391 aa  715    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0578  elongation factor Tu  93.09 
 
 		 391 aa  715    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 396 aa  634    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 396 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  79.04 
 
 		 396 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  81.06 
 
 		 396 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  81.31 
 
 		 396 aa  663    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  82.32 
 
 		 396 aa  670    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  82.32 
 
 		 396 aa  670    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  79.95 
 
 		 396 aa  648    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  78.34 
 
 		 397 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  81.31 
 
 		 396 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  81.31 
 
 		 396 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  80.81 
 
 		 396 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1330  elongation factor Tu  83.38 
 
 		 391 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262111  normal  0.0428037 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  88.46 
 
 		 391 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0242  elongation factor Tu  93.33 
 
 		 391 aa  710    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.333301  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2434  elongation factor Tu  93.33 
 
 		 391 aa  710    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.349806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0274  elongation factor Tu  100 
 
 		 391 aa  791    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  79.04 
 
 		 396 aa  644    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0664  elongation factor Tu  84.14 
 
 		 391 aa  650    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000028425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1680  elongation factor Tu  84.14 
 
 		 391 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0832876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1826  elongation factor Tu  84.14 
 
 		 391 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  79.8 
 
 		 396 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  79.04 
 
 		 396 aa  644    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0223  elongation factor Tu  100 
 
 		 391 aa  791    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0969  elongation factor Tu  84.91 
 
 		 391 aa  658    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0124791 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1797  elongation factor Tu  84.85 
 
 		 396 aa  656    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.871801  normal  0.0555959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1814  elongation factor Tu  84.85 
 
 		 396 aa  656    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1413  elongation factor Tu  82.35 
 
 		 391 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1428  elongation factor Tu  82.35 
 
 		 391 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00224702  decreased coverage  0.00405593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  79.8 
 
 		 396 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  78.03 
 
 		 396 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  78.79 
 
 		 396 aa  641    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  88.46 
 
 		 391 aa  716    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>