More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2158 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  100 
 
 		 382 aa  778    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0922  peptidase M23B  39.02 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.611629  normal  0.45806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  34.69 
 
 		 369 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2869  Peptidase M23  35.2 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  37.82 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  25.94 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  29.26 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  29.14 
 
 		 366 aa  102  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  27.7 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  28.57 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  24.57 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  25.13 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  27.73 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  22.82 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  38.35 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  33.91 
 
 		 509 aa  86.7  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  32.13 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  31.61 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  31.11 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  32.04 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  26.94 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  40.74 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  26.63 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  21.24 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  29.91 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  29.79 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  24.16 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  37.5 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  24.29 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  25.66 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  29.6 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  36.3 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  31.16 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  37.04 
 
 		 516 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  30.48 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  30.48 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  30.48 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  25.45 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  28.3 
 
 		 500 aa  79.3  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  34.4 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  36.22 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  29.69 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  38.05 
 
 		 602 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  33.33 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  26.51 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  31.69 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  31.69 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  37.9 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  36.72 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  30.6 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  36.72 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  32.16 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  36.72 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  24.59 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  28.06 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  36.72 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  24.36 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  37.9 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  36.43 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  37.9 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  25.52 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  32.8 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  36.51 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  35.56 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  36.51 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  37.1 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  36.51 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  34.62 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  34.38 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  34.19 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  25.99 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  34.15 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  34.43 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  21.93 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  33.61 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  35.94 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  33.59 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  33.61 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  36.29 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  33.61 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  35.25 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  36.17 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  35.56 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  32.17 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  32.77 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  23.69 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  33.09 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  33.09 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  33.09 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  33.09 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  33.09 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  33.09 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  33.09 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  33.09 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  33.09 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>