93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1921 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  100 
 
 
301 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  41.16 
 
 
337 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  47.08 
 
 
330 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  47.48 
 
 
330 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  41.15 
 
 
316 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  34.65 
 
 
307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  36.05 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  41.84 
 
 
312 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  35.37 
 
 
307 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  39.27 
 
 
308 aa  168  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  39.36 
 
 
309 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  37.96 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  41.84 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  37.19 
 
 
284 aa  163  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  38.46 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  38.15 
 
 
306 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  37.25 
 
 
304 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  36.84 
 
 
304 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  36.84 
 
 
304 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  36.84 
 
 
304 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  36.84 
 
 
304 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  36.84 
 
 
304 aa  159  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  37.25 
 
 
315 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  36.84 
 
 
304 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  39.75 
 
 
309 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  36.44 
 
 
304 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  36.73 
 
 
305 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  37.45 
 
 
294 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  37.74 
 
 
309 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  37.65 
 
 
311 aa  155  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  39.2 
 
 
317 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  37.87 
 
 
293 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  36.82 
 
 
310 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  43.67 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  40.14 
 
 
305 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  39.45 
 
 
308 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  36.57 
 
 
292 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  39.84 
 
 
314 aa  148  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  36.6 
 
 
292 aa  148  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  39.6 
 
 
290 aa  145  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  33.85 
 
 
341 aa  143  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  34.65 
 
 
294 aa  142  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  33.88 
 
 
291 aa  137  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  35.27 
 
 
324 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  43.03 
 
 
297 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  39.06 
 
 
314 aa  132  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  30.27 
 
 
342 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  35.09 
 
 
278 aa  129  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  33.77 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  35.71 
 
 
334 aa  119  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  37.55 
 
 
565 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  33.1 
 
 
318 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  33.78 
 
 
319 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  33.1 
 
 
309 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  29.41 
 
 
268 aa  99  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  27.89 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  27.89 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  29.41 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  31.4 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  32.84 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  34.4 
 
 
320 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  30.12 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  30.12 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  30.12 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  30.12 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  30.12 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  30.12 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  30.12 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  30.12 
 
 
268 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  27.97 
 
 
303 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  31.99 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  27.78 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  28.68 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  35.89 
 
 
316 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  26.81 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  23.95 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  28.19 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  29.54 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  28.63 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  26.91 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2501  protein of unknown function DUF368  33.47 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  24.9 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  28.1 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  26.62 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  27.02 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  24.21 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  23.41 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1873  protein of unknown function DUF368  26.1 
 
 
248 aa  62.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000015734  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  26.48 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  26.02 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1510  protein of unknown function DUF368  30.28 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  25.86 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0187  protein of unknown function DUF368  21.54 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>