53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0918 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
384 aa  793    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3149  metallo-beta-lactamase family protein  75.33 
 
 
391 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0567281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  71.02 
 
 
391 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  67.81 
 
 
386 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1722  metallo-beta-lactamase family protein  65 
 
 
382 aa  548  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  62.63 
 
 
385 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.16796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  60.47 
 
 
385 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2374  beta-lactamase-like  34.19 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26413  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  27.59 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.85 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  23.37 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  26.41 
 
 
278 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 
322 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  23.77 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2299  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  25 
 
 
276 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4225  beta-lactamase domain-containing protein  25.3 
 
 
276 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.150926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  26.29 
 
 
312 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3320  beta-lactamase domain-containing protein  24.36 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0328164  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0068  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.71 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 
284 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  24.73 
 
 
221 aa  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 
280 aa  49.7  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
327 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 
274 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  22.09 
 
 
295 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 
212 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  23.28 
 
 
282 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 
229 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  23.41 
 
 
276 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 
278 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0397  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 
276 aa  46.6  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257188  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2186  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 
262 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  20.94 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0149  hypothetical protein  24.71 
 
 
282 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0023  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.94 
 
 
281 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0773  beta-lactamase domain protein  25.43 
 
 
237 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  22.17 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2078  beta-lactamase domain-containing protein  22.61 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 
267 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 
272 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5934  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
372 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  23.41 
 
 
276 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  21.58 
 
 
294 aa  43.1  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1434  beta-lactamase domain-containing protein  22.47 
 
 
276 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1064  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 
372 aa  43.1  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393014  normal  0.0622516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>