26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0877 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  100 
 
 		 557 aa  1147    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  44.54 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  47.13 
 
 		 556 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  43.19 
 
 		 555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  39.33 
 
 		 538 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  36.33 
 
 		 514 aa  325  9e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2038  cytochrome c class III  38.83 
 
 		 326 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  31.55 
 
 		 225 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1706  hypothetical protein  34.33 
 
 		 176 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  30.6 
 
 		 176 aa  54.3  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0679  hypothetical protein  30.49 
 
 		 175 aa  53.5  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000135984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0847  hypothetical protein  35.11 
 
 		 134 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00928688  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  34.69 
 
 		 147 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  25.93 
 
 		 664 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0666  hypothetical protein  31.06 
 
 		 174 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  24.53 
 
 		 426 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  24.26 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  36.36 
 
 		 135 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  24.62 
 
 		 247 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  34.57 
 
 		 143 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  25.45 
 
 		 266 aa  45.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  21.92 
 
 		 790 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  34.57 
 
 		 144 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  27.23 
 
 		 335 aa  43.9  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4047  cytochrome c, class III  31.37 
 
 		 149 aa  43.9  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000990135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  32.14 
 
 		 581 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>