More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0656 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 871 aa  1756    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1370  CheA signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 687 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0938961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 		 730 aa  452  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 770 aa  432  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  33.72 
 
 		 887 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  37.89 
 
 		 662 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2487  CheA signal transduction histidine kinase  50.64 
 
 		 725 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2583  CheA signal transduction histidine kinase  50.64 
 
 		 711 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 954 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  37.44 
 
 		 655 aa  382  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 604 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  44.94 
 
 		 674 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 598 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  46.01 
 
 		 669 aa  376  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  43.45 
 
 		 678 aa  375  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  35.89 
 
 		 610 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 682 aa  373  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 607 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  38.5 
 
 		 625 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  47.94 
 
 		 699 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 694 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 603 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  48.56 
 
 		 684 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.86 
 
 		 770 aa  367  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  47.29 
 
 		 709 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  35.02 
 
 		 769 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  49.23 
 
 		 749 aa  365  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  44 
 
 		 681 aa  365  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  35.13 
 
 		 769 aa  365  2e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  36.05 
 
 		 783 aa  364  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  34.98 
 
 		 774 aa  364  3e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  35.51 
 
 		 783 aa  364  4e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  36.27 
 
 		 601 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  49.11 
 
 		 750 aa  363  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.82 
 
 		 806 aa  363  9e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  49.11 
 
 		 756 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  49.11 
 
 		 756 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  34.81 
 
 		 769 aa  362  2e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  48.98 
 
 		 743 aa  361  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  49.23 
 
 		 744 aa  361  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  44.66 
 
 		 715 aa  360  5e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.41 
 
 		 770 aa  360  5e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  47.31 
 
 		 732 aa  360  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  48.16 
 
 		 669 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  48.69 
 
 		 724 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  35.26 
 
 		 785 aa  359  9.999999999999999e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  49.48 
 
 		 749 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  48.69 
 
 		 724 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  48.16 
 
 		 669 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  48.69 
 
 		 726 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  48.68 
 
 		 672 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  48.16 
 
 		 654 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  48.16 
 
 		 654 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  47.89 
 
 		 669 aa  358  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  49.35 
 
 		 767 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  49.35 
 
 		 767 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  48.16 
 
 		 654 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  47.89 
 
 		 669 aa  358  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  48.16 
 
 		 654 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 606 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  43.86 
 
 		 717 aa  358  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  48.16 
 
 		 654 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  48.16 
 
 		 652 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  49.35 
 
 		 767 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  48.16 
 
 		 652 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  34.87 
 
 		 758 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  49.35 
 
 		 767 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  47.89 
 
 		 669 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  48.16 
 
 		 654 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  49.48 
 
 		 762 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  47.89 
 
 		 654 aa  357  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  49.48 
 
 		 765 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 1031 aa  357  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  49.48 
 
 		 765 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 		 761 aa  357  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  43.76 
 
 		 717 aa  356  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 		 725 aa  356  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  45.17 
 
 		 784 aa  355  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  40.16 
 
 		 766 aa  355  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 796 aa  355  2.9999999999999997e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  45.43 
 
 		 715 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  47.38 
 
 		 772 aa  354  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  42.83 
 
 		 727 aa  353  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  41.02 
 
 		 703 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 		 766 aa  352  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  47.64 
 
 		 691 aa  351  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 724 aa  349  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 		 878 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 653 aa  348  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  43.57 
 
 		 691 aa  348  3e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 		 728 aa  347  7e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  44.58 
 
 		 673 aa  346  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  35.82 
 
 		 766 aa  346  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 		 702 aa  345  2e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  47.57 
 
 		 697 aa  345  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 707 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 		 724 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  47.91 
 
 		 722 aa  344  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  45.48 
 
 		 729 aa  342  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  46.75 
 
 		 747 aa  341  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>