47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2993 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2993  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1628  metallo-beta-lactamase family protein  31.18 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1510  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0797  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0801  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 		 288 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1373  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0750  Beta-lactamase-like  29.33 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0787  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0367408 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0654  hypothetical protein  27.92 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1134  hypothetical protein  30.86 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.449288  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1330  hypothetical protein  31.79 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.493645  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0588  hypothetical protein  33.53 
 
 		 266 aa  92.8  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0235  hypothetical protein  31.21 
 
 		 266 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107264  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0810  hypothetical protein  26.57 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.960554  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0751  beta-lactamase domain protein  24.03 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0809  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  30.77 
 
 		 492 aa  55.8  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0922  hypothetical protein  31.17 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  22.35 
 
 		 270 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0648  beta-lactamase domain protein  27.01 
 
 		 259 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  26.23 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  22.83 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  25.73 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.7 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  24.29 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0841  beta-lactamase-like protein  23.17 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000232036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0985  beta-lactamase-like protein  23.17 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000377257  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.49 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  32.53 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1139  Beta-lactamase-like  26.71 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000269692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  24.04 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4326  beta-lactamase-like  27.66 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.111759  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2194  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 279 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09800  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.52 
 
 		 266 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.559051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  23.37 
 
 		 244 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  23.75 
 
 		 244 aa  42.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.09 
 
 		 250 aa  42.7  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  26.79 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.35 
 
 		 251 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.09 
 
 		 250 aa  42.4  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  38.96 
 
 		 237 aa  42.4  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.09 
 
 		 250 aa  42.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  24.73 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>