More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2396 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
257 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  65.62 
 
 
256 aa  334  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  61.7 
 
 
260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  65.47 
 
 
223 aa  299  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  59.82 
 
 
256 aa  298  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  64.04 
 
 
317 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  60.09 
 
 
247 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  59.21 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  58.59 
 
 
250 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  56.9 
 
 
251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  59.09 
 
 
255 aa  280  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  56.33 
 
 
257 aa  279  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  62.38 
 
 
222 aa  275  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  61.43 
 
 
222 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  60.71 
 
 
254 aa  274  9e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  55.95 
 
 
247 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  53.25 
 
 
252 aa  271  9e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  61.11 
 
 
221 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  55.61 
 
 
231 aa  268  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  55.2 
 
 
252 aa  268  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  50.19 
 
 
260 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  53.36 
 
 
245 aa  266  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  47.73 
 
 
266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  55.41 
 
 
244 aa  263  2e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  54.96 
 
 
244 aa  263  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  55.41 
 
 
251 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  55.41 
 
 
244 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  55.86 
 
 
244 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  53.75 
 
 
238 aa  258  7e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  54.95 
 
 
244 aa  258  8e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  54.95 
 
 
251 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  52.92 
 
 
248 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  54.5 
 
 
261 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  54.95 
 
 
251 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  55.61 
 
 
255 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  57.6 
 
 
246 aa  256  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  54.24 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  52.59 
 
 
280 aa  252  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  52.79 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1017  flagellar biosynthesis protein FliP  52.16 
 
 
246 aa  251  5.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.830482  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  54.5 
 
 
250 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  55.17 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  61.38 
 
 
255 aa  251  9.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  53.07 
 
 
252 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  50.99 
 
 
252 aa  249  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4138  flagellar biosynthesis protein FliP  54.86 
 
 
259 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00317054  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  52.23 
 
 
254 aa  248  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  53.39 
 
 
293 aa  248  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  57.43 
 
 
261 aa  248  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  59.11 
 
 
250 aa  247  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  56.93 
 
 
251 aa  247  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  56.93 
 
 
251 aa  247  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0689  flagellar biosynthesis protein FliP  51.23 
 
 
243 aa  246  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0220519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  55 
 
 
281 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  60.85 
 
 
262 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  57.64 
 
 
264 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  56.93 
 
 
262 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  56.93 
 
 
262 aa  245  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  52.94 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  56.65 
 
 
265 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  52.7 
 
 
254 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  57.43 
 
 
245 aa  244  9e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  52.5 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  56.44 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  55.17 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  51.26 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  56.11 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  52.94 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  56.11 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  52.94 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  50.21 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  51.26 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  60.32 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  52.94 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0978  flagellar biosynthesis protein FliP  53.47 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  0.0315075 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  56.93 
 
 
245 aa  242  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  56.93 
 
 
245 aa  242  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  56.93 
 
 
245 aa  242  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  56.93 
 
 
245 aa  242  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  56.93 
 
 
245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  56.93 
 
 
245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 
245 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 
245 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 
245 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 
245 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  53.12 
 
 
289 aa  241  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  50.4 
 
 
266 aa  241  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 
245 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  51.26 
 
 
251 aa  241  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  56.16 
 
 
278 aa  241  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  56.93 
 
 
258 aa  241  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  53.51 
 
 
249 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  54.05 
 
 
255 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  53.77 
 
 
255 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 
253 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  53.77 
 
 
255 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 
276 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  56.93 
 
 
260 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>