More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0253 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 396 aa  812    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  68.8 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  68.21 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  71.65 
 
 		 394 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  67.68 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  69.43 
 
 		 401 aa  566  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  69.43 
 
 		 399 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  69.43 
 
 		 399 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  68.39 
 
 		 405 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  68.7 
 
 		 409 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 397 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  70.15 
 
 		 395 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  69.09 
 
 		 409 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 		 397 aa  554  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  69.23 
 
 		 402 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  68.19 
 
 		 399 aa  552  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  65.64 
 
 		 402 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  65.81 
 
 		 391 aa  551  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  67.94 
 
 		 403 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 		 397 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 		 401 aa  549  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 		 400 aa  548  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 		 411 aa  548  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 		 399 aa  547  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 		 399 aa  547  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  64.75 
 
 		 409 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  67.44 
 
 		 403 aa  545  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  65.05 
 
 		 402 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 396 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  65.56 
 
 		 402 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  64.52 
 
 		 409 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 394 aa  544  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  64.63 
 
 		 396 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  64.89 
 
 		 406 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 		 407 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  64.03 
 
 		 405 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  64.29 
 
 		 405 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 410 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  64.63 
 
 		 404 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 		 397 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  64.29 
 
 		 405 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  63.38 
 
 		 414 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  65.65 
 
 		 397 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  64.63 
 
 		 410 aa  538  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  64.29 
 
 		 405 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  65.48 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  65.64 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  65.39 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 411 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  65.63 
 
 		 403 aa  535  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  64.12 
 
 		 411 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  65.38 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 		 418 aa  537  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  63.45 
 
 		 410 aa  531  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  65.39 
 
 		 405 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  65.64 
 
 		 397 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  63.87 
 
 		 398 aa  531  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  63.61 
 
 		 406 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  65.8 
 
 		 405 aa  533  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  64.54 
 
 		 404 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  66.15 
 
 		 399 aa  528  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  65.13 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  63.17 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 		 424 aa  526  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  65.88 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  64.72 
 
 		 428 aa  528  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  64.19 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 424 aa  526  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  64.12 
 
 		 406 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  63.75 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  63.43 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  64.56 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 399 aa  524  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  63.17 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  63.17 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.17 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 415 aa  522  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 		 406 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  61.93 
 
 		 409 aa  524  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  64.47 
 
 		 435 aa  521  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  64.81 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  64.47 
 
 		 404 aa  521  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 397 aa  521  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>