More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0966 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  60.83 
 
 		 514 aa  664    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  60.63 
 
 		 516 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  100 
 
 		 509 aa  1041    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  61.42 
 
 		 516 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  60.83 
 
 		 516 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  60.83 
 
 		 517 aa  664    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  58.66 
 
 		 511 aa  628  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  57.56 
 
 		 518 aa  631  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  58.51 
 
 		 514 aa  626  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  58.51 
 
 		 514 aa  626  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  57.56 
 
 		 521 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  58.01 
 
 		 518 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  56.2 
 
 		 520 aa  619  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  57.06 
 
 		 515 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  55.15 
 
 		 575 aa  617  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  58.4 
 
 		 518 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  56.69 
 
 		 511 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  58.4 
 
 		 518 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  56.19 
 
 		 516 aa  614  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  58.2 
 
 		 518 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  57.53 
 
 		 523 aa  608  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  57.53 
 
 		 520 aa  610  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  56.19 
 
 		 510 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  58.12 
 
 		 518 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  59.3 
 
 		 520 aa  609  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  56.75 
 
 		 520 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  57.89 
 
 		 525 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  54.76 
 
 		 542 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  55.4 
 
 		 510 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  55.56 
 
 		 526 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  56.86 
 
 		 515 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  58.12 
 
 		 524 aa  609  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  54.76 
 
 		 542 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  54.62 
 
 		 513 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  55.88 
 
 		 522 aa  611  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  57.34 
 
 		 520 aa  609  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  56.56 
 
 		 520 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  56.75 
 
 		 520 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  56.78 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  55.15 
 
 		 540 aa  605  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  54.42 
 
 		 513 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  58.9 
 
 		 520 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  54.9 
 
 		 515 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  56.39 
 
 		 510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  55.97 
 
 		 516 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  55.69 
 
 		 515 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  53.2 
 
 		 542 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  57.42 
 
 		 519 aa  601  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  57.93 
 
 		 520 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  57.76 
 
 		 533 aa  598  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  57.34 
 
 		 528 aa  600  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  56.95 
 
 		 534 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  53.59 
 
 		 540 aa  599  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  55.58 
 
 		 520 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  57.56 
 
 		 560 aa  600  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  56.41 
 
 		 527 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  55.01 
 
 		 509 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  54.81 
 
 		 509 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  53.4 
 
 		 575 aa  600  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  57.14 
 
 		 541 aa  598  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  53.79 
 
 		 537 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  58.32 
 
 		 518 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  55.92 
 
 		 528 aa  597  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  57.56 
 
 		 560 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  55.97 
 
 		 519 aa  596  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  58.12 
 
 		 518 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  56.21 
 
 		 527 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  56.75 
 
 		 521 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  53.92 
 
 		 511 aa  594  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  56.75 
 
 		 521 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.97 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  56.95 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  54.31 
 
 		 511 aa  592  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  57.14 
 
 		 520 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  53.68 
 
 		 525 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  55.12 
 
 		 512 aa  594  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.42 
 
 		 512 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  53.35 
 
 		 517 aa  593  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  55.77 
 
 		 526 aa  592  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  56.5 
 
 		 511 aa  592  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  56.78 
 
 		 506 aa  593  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  53.74 
 
 		 517 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.9 
 
 		 511 aa  594  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.46 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  56.75 
 
 		 521 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  53.49 
 
 		 525 aa  591  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  55.31 
 
 		 512 aa  588  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  53.49 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  53.49 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  55.99 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  53.92 
 
 		 507 aa  588  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  56.56 
 
 		 535 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  54.76 
 
 		 528 aa  590  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  53.29 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1681  GMP synthase  52.71 
 
 		 529 aa  588  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  53.49 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  53.29 
 
 		 525 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  53.49 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  53.29 
 
 		 525 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  53.29 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>