More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1471 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  98.74 
 
 		 397 aa  774    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  100 
 
 		 396 aa  817    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  95.97 
 
 		 397 aa  781    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  47.02 
 
 		 319 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  44 
 
 		 304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  41.39 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  42.37 
 
 		 282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  39 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  40.73 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  39.87 
 
 		 299 aa  199  7e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  43.22 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  39.12 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  40.88 
 
 		 286 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  38.87 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  38.74 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  39 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  40.54 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  42.03 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  40.75 
 
 		 283 aa  186  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  38.8 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  43.94 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  37.84 
 
 		 316 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  37.29 
 
 		 282 aa  182  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  39.93 
 
 		 285 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  41.41 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  40.85 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  35.24 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  42.69 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  38.44 
 
 		 298 aa  179  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  38.73 
 
 		 286 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  38.51 
 
 		 315 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  37.37 
 
 		 279 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  40.71 
 
 		 287 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  38.31 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  39.39 
 
 		 279 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  40.23 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  39.73 
 
 		 282 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  39.6 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  40.68 
 
 		 297 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  38.31 
 
 		 287 aa  173  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  40.49 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  40.49 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  40.71 
 
 		 287 aa  172  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  36.7 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  37.04 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  38.26 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  36.7 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  39.02 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  37.41 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  38.38 
 
 		 324 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  39.41 
 
 		 285 aa  170  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  40.5 
 
 		 280 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  38.91 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  39.39 
 
 		 294 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  40.08 
 
 		 281 aa  169  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  36.36 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  40.3 
 
 		 285 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  39.58 
 
 		 280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  36.7 
 
 		 288 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  36.48 
 
 		 318 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  37.04 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  33.78 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  36.58 
 
 		 317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  37.78 
 
 		 296 aa  166  8e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  37.37 
 
 		 285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  39.85 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  38.05 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  37.71 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  39.46 
 
 		 289 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  37.04 
 
 		 285 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  37.04 
 
 		 285 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  38.72 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  37.04 
 
 		 283 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  38.72 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  37.32 
 
 		 284 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  39.6 
 
 		 284 aa  163  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  37.46 
 
 		 285 aa  163  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  37.46 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  37.37 
 
 		 285 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  37.37 
 
 		 285 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  36.72 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  37.37 
 
 		 285 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  39.13 
 
 		 284 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  37.37 
 
 		 285 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  37.37 
 
 		 285 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  37.37 
 
 		 285 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  37.37 
 
 		 285 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  38 
 
 		 283 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 		 286 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1529  peptidase M48 Ste24p  40.28 
 
 		 281 aa  161  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  37.04 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  38.78 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  38.38 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  37.46 
 
 		 285 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  36.7 
 
 		 285 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  36.7 
 
 		 285 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  36.7 
 
 		 285 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0833  peptidase M48 Ste24p  38.55 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  39.46 
 
 		 280 aa  159  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  38.38 
 
 		 279 aa  159  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>