More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_137 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_137  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 123 aa  253  4e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  97.56 
 
 		 123 aa  249  7e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0130  response regulator  86.89 
 
 		 123 aa  227  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  45.53 
 
 		 231 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  45.53 
 
 		 231 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 		 223 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 		 223 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 232 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  46.9 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  46.9 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 237 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  42.28 
 
 		 223 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  42.28 
 
 		 223 aa  103  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 236 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 240 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  38.21 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 233 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 238 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 		 230 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 231 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 234 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.17 
 
 		 509 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  41.46 
 
 		 238 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 243 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 223 aa  99.4  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 238 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.65 
 
 		 310 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 231 aa  97.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 242 aa  97.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 247 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 234 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 239 aa  97.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  40.34 
 
 		 238 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  40.34 
 
 		 238 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 242 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  40.34 
 
 		 250 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  40.34 
 
 		 250 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  40.34 
 
 		 238 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  40.34 
 
 		 238 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  40.34 
 
 		 238 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  40.34 
 
 		 250 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  40.34 
 
 		 238 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 230 aa  97.1  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  43.36 
 
 		 234 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 226 aa  97.1  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 230 aa  97.1  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 237 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 237 aa  95.9  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 121 aa  95.9  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 244 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 230 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 224 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  42.24 
 
 		 248 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 248 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  42.24 
 
 		 248 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  42.48 
 
 		 234 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 237 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 248 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 225 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 239 aa  94.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 243 aa  94.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 239 aa  94.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 243 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 243 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  38.21 
 
 		 248 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  39.34 
 
 		 237 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  37.4 
 
 		 248 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 934 aa  94.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 134 aa  94  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 225 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 223 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  37.4 
 
 		 248 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  42.24 
 
 		 248 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 233 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 241 aa  94  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 256 aa  93.6  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0402  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 241 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  40.68 
 
 		 241 aa  94  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 223 aa  93.6  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  41.59 
 
 		 233 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  38.66 
 
 		 241 aa  93.2  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  43.1 
 
 		 248 aa  93.6  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  38.66 
 
 		 241 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  38.66 
 
 		 241 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 233 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 233 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  42.48 
 
 		 233 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  39.02 
 
 		 237 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 233 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.28 
 
 		 238 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 233 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 234 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 246 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  38.66 
 
 		 241 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 232 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>