47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2622 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 321 aa  658    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  47.54 
 
 		 392 aa  285  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  47.92 
 
 		 393 aa  278  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  35.68 
 
 		 391 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  35.32 
 
 		 373 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  33.67 
 
 		 406 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  30.74 
 
 		 453 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  30.95 
 
 		 397 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  32.56 
 
 		 397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  31.78 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  31.12 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  29.55 
 
 		 360 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  30.21 
 
 		 389 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  30.14 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  29.09 
 
 		 399 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  26.76 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  29.15 
 
 		 969 aa  109  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  25.89 
 
 		 480 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  28.62 
 
 		 572 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  28.3 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2105  hypothetical protein  26.98 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  27.6 
 
 		 681 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.38 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  30.17 
 
 		 726 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  32.73 
 
 		 687 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.15 
 
 		 580 aa  53.1  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  33.71 
 
 		 728 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.27 
 
 		 229 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.97 
 
 		 197 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.93 
 
 		 185 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.57 
 
 		 200 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.78 
 
 		 190 aa  46.6  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  35.04 
 
 		 788 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1134  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.43 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.43 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  32.56 
 
 		 696 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2339  FMN-binding domain protein  20.32 
 
 		 638 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 714 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  29.38 
 
 		 787 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  32.56 
 
 		 715 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  29.38 
 
 		 763 aa  43.9  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0213  FMN-binding domain-containing protein  27.86 
 
 		 218 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000585453  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  25.35 
 
 		 189 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  23.81 
 
 		 702 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  27.5 
 
 		 201 aa  42.7  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  35.37 
 
 		 749 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  26.61 
 
 		 764 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>