37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2053 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 118 aa  240  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.68 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0016  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  32.41 
 
 		 447 aa  47.4  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  28.87 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  29.82 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  33.01 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  31.52 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  32 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  35.62 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  35.71 
 
 		 163 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  30.61 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 255 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  25.53 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  27.43 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  31.15 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  32.26 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.33 
 
 		 386 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  30.61 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  36.17 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  30.23 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.45 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  32.5 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 161 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>