41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1656 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  714    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0845  hypothetical protein  35.9 
 
 
358 aa  219  7.999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  23.62 
 
 
411 aa  77  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  25.07 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  23.35 
 
 
405 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  22.34 
 
 
395 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  25 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  23.24 
 
 
390 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  26.17 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  26.17 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  26.17 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  23.71 
 
 
384 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  23.71 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  23.71 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  26.17 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  26.04 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  26.17 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  26.04 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  26.04 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  26.75 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  23.71 
 
 
384 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  28.57 
 
 
400 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  23.45 
 
 
384 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  23.79 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  29.94 
 
 
396 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  23.72 
 
 
408 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  23.56 
 
 
405 aa  46.6  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  26.25 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  23.19 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  25.79 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  21.11 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  22.98 
 
 
399 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  21.16 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  20.71 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  25.29 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  23.55 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  27.97 
 
 
389 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  25.81 
 
 
386 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  25.81 
 
 
386 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  25.38 
 
 
430 aa  42.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4174  putative acyltransferase  26.3 
 
 
373 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>