More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1224 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 118 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  37.29 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  46.34 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  43.42 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  53.73 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  42.17 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  38.79 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  41.98 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  39.78 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  50.72 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  38.26 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  35.63 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  35.63 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  47.06 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  35.63 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  36.7 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.38 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  33.93 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  45.71 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0755  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.554367  normal  0.0268545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  42.03 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  50 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  33.04 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  32.41 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  43.66 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.83 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  38.55 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  38.55 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  39.29 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>