More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2664 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
291 aa  578  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0439942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.8 
 
 
288 aa  242  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.930102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 
283 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0857223  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0376  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  44.07 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2710  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  44.07 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0397  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  44.07 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0113  putative sugar ABC transporter (permease protein)  41.33 
 
 
282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0300  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  43.7 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
282 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.174842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
283 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
282 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96596  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1285  twin-arginine translocation pathway signal  40.66 
 
 
283 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
282 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0316  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  42.59 
 
 
281 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0325  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  42.59 
 
 
281 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.49 
 
 
282 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3019  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  43.33 
 
 
281 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.49 
 
 
282 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
277 aa  207  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
282 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17735  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2742  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  42.96 
 
 
281 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3724  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  42.96 
 
 
281 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359275  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
282 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342174  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3211  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  42.96 
 
 
281 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.198924  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1762  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  42.96 
 
 
281 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3753  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  42.96 
 
 
281 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2792  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  42.96 
 
 
281 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.18 
 
 
282 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3854  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  40.59 
 
 
281 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3695  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  42.59 
 
 
281 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3494  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  45.76 
 
 
281 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0446  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  42.29 
 
 
281 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152206  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
282 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2711  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  42.02 
 
 
281 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027951  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
282 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.70012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3511  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  41.9 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450535  normal  0.0797424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0236  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  40.22 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.325941 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3730  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  39.85 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2016  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein  39.49 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0189923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3926  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  40.96 
 
 
281 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3746  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  40.96 
 
 
281 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3824  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  40.96 
 
 
281 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3757  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  40.96 
 
 
281 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3867  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  40.96 
 
 
281 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
282 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110391  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
279 aa  200  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0553602  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3929  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  39.85 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5505  ABC transporter membrane spanning protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  39.79 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03300  glycerol-3-phosphate transporter subunit  39.85 
 
 
281 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0265  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  39.85 
 
 
281 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3648  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  39.85 
 
 
281 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03253  hypothetical protein  39.85 
 
 
281 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4765  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  39.85 
 
 
281 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3872  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  39.85 
 
 
281 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2095  sn-glycerol-3-phosphate ABC transporter, binding protein inner membrane component  45.15 
 
 
282 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.565936 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3960  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  40.37 
 
 
281 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.53735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3653  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  40.37 
 
 
281 aa  198  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.703589 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0258  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  40.37 
 
 
281 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06398  ABC-type sugar transport system permease  38.01 
 
 
282 aa  198  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1695  hypothetical protein  41.64 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
276 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1694  hypothetical protein  41.26 
 
 
275 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1266  SN-glycerol-3-phosphate transmembrane ABC transporter protein  41.77 
 
 
282 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75502  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
291 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.86109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3859  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  40.44 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4043  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  40.44 
 
 
282 aa  188  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
283 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
306 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.493685 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
282 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3283  hypothetical protein  38.01 
 
 
282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.936696  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209933 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3288  ABC glycerol-3-phosphate transporter, inner membrane subunit UgpE  38.01 
 
 
287 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0119  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  38.75 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0127  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  39.11 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
287 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.340466  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
282 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.606554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
281 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12847  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0619  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  37.93 
 
 
282 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0347  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.66 
 
 
283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0657  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
282 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
307 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
278 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
305 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0357  ABC transporter membrane spanning protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  36.26 
 
 
280 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
300 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  0.306181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18870  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.14 
 
 
319 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.55 
 
 
273 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.55 
 
 
273 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>