More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2382 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  100 
 
 
318 aa  645    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.60479  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  62.95 
 
 
392 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4014  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.98 
 
 
390 aa  363  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1564  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  61.54 
 
 
391 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0892208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.22 
 
 
407 aa  359  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2506  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.2 
 
 
392 aa  358  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2447  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.58 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1551  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.54 
 
 
407 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2040  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.2 
 
 
394 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.21 
 
 
407 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0053  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.21 
 
 
413 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1482  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.21 
 
 
413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0055  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.21 
 
 
413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1199  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.21 
 
 
413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0066  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.88 
 
 
413 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469601  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2054  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.57 
 
 
408 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541897  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2230  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.86 
 
 
392 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2242  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.22 
 
 
410 aa  344  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3157  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.58 
 
 
410 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65281  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5289  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.19 
 
 
410 aa  338  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5016  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.25 
 
 
410 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.92 
 
 
410 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1625  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.52 
 
 
395 aa  337  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5114  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.59 
 
 
410 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.223132  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5745  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.59 
 
 
410 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758891  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3130  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.59 
 
 
410 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26690  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.86 
 
 
391 aa  334  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140669  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4006  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.19 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4456  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.53 
 
 
392 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2458  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.72 
 
 
400 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7610  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.53 
 
 
392 aa  305  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3851  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.16 
 
 
397 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000154299  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7086  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.79 
 
 
391 aa  298  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2184  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.85 
 
 
389 aa  295  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.51 
 
 
391 aa  295  8e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1534  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.58 
 
 
405 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  0.0830995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03050  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.5 
 
 
394 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00335247  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3583  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.34 
 
 
389 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.114816  normal  0.502455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0332  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.17 
 
 
394 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1983  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.16 
 
 
390 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3537  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.5 
 
 
395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0707  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.49 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531901  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1884  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.5 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.150769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4886  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.11 
 
 
407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.879694  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6220  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.49 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1946  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.17 
 
 
395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0857423  hitchhiker  0.00135918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.15 
 
 
396 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0441  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50 
 
 
399 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.7 
 
 
395 aa  282  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3479  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.17 
 
 
389 aa  282  6.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5020  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.84 
 
 
389 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2387  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.84 
 
 
395 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.665407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0339  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50 
 
 
401 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.972507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14390  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.84 
 
 
394 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2237  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.83 
 
 
421 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4161  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.16 
 
 
389 aa  279  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.314904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1850  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.35 
 
 
396 aa  278  7e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.5 
 
 
393 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2831  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.34 
 
 
391 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543631  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2992  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.17 
 
 
389 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287088  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3893  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.49 
 
 
404 aa  275  8e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4018  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.84 
 
 
398 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1901  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.82 
 
 
394 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.213246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.83 
 
 
389 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4358  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.84 
 
 
391 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119328  normal  0.266581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2684  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.16 
 
 
390 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.16 
 
 
397 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2436  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.83 
 
 
389 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.873151  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0347  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.17 
 
 
395 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0561  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.16 
 
 
389 aa  266  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.061935  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3182  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.16 
 
 
390 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3474  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.82 
 
 
390 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0603  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.49 
 
 
389 aa  262  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.862767  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0641  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.49 
 
 
389 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.5 
 
 
389 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329756  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3500  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.82 
 
 
394 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.835067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2710  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.92 
 
 
390 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1907  p-hydroxybenzoate hydroxylase  46.49 
 
 
394 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0133295  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3723  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.16 
 
 
389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5420  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.61 
 
 
400 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4202  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.15 
 
 
390 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6123  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.83 
 
 
390 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66418  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2682  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.91 
 
 
402 aa  249  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0923834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.15 
 
 
390 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526509  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3796  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  35.22 
 
 
396 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0336813  normal  0.0760844 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  24.68 
 
 
552 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  27.38 
 
 
556 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  26.37 
 
 
501 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  23.38 
 
 
414 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  27.42 
 
 
478 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  27.42 
 
 
535 aa  63.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  27.1 
 
 
478 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  27.1 
 
 
478 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  24.54 
 
 
585 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  24.12 
 
 
545 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  24.93 
 
 
531 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  26.14 
 
 
511 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  24.76 
 
 
553 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  24.68 
 
 
555 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  24.68 
 
 
558 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>