79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2062 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2062  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
156 aa  315  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  43.51 
 
 
168 aa  122  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
340 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
326 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
167 aa  57.4  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
320 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02981  hypothetical protein  27.19 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.553777  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3824  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114693  normal  0.354709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
347 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.59 
 
 
349 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2311  GCN5-related N-acetyltransferase  43.24 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
349 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.2 
 
 
299 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6122  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
314 aa  47.8  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
316 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  31.91 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3612  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
160 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.601769  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  31.91 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5968  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  28.04 
 
 
312 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6009  cytoplasmic peptidoglycan synthetase domain protein  30.36 
 
 
631 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  38.89 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
309 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
340 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
326 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  27.59 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  26.4 
 
 
299 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22510  Acetyltransferase, GNAT family  32.43 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.919154  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1818  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.148545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0143  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
221 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
334 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5712  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
313 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  25.53 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1218  acetyltransferase  27.34 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.065696  normal  0.121515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  26.98 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.20692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9151  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase-like protein  30.84 
 
 
195 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
307 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
305 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6566  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0520  acetyltransferase  35.21 
 
 
156 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
308 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64320  hypothetical protein  33.87 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161713  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  29.91 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
307 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.38 
 
 
320 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  31.25 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.93 
 
 
312 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4297  GCN5-related N-acetyltransferase  26.13 
 
 
171 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00299147  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03050  predicted acetyltransferase  30.43 
 
 
211 aa  41.2  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
152 aa  41.2  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.21 
 
 
322 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1847  acetyltransferase  37.88 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0423  acetyltransferase  37.88 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 
166 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.11668 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.78 
 
 
147 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2150  acetyltransferase  35.21 
 
 
139 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0834  acetyltransferase  37.88 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
299 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
315 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  28.12 
 
 
161 aa  40.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.89 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5584  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
172 aa  40.4  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>