More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1343 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
326 aa  641    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.545551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.6 
 
 
332 aa  309  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00733957  hitchhiker  0.00049009 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
322 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.161485  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
321 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
358 aa  233  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
326 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00111488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.89 
 
 
345 aa  225  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
349 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  hitchhiker  0.0000268959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
349 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  36.96 
 
 
348 aa  225  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
353 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 
321 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  40.18 
 
 
321 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
328 aa  221  9e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000323084  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
321 aa  221  9e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
331 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
321 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
321 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
322 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  36.09 
 
 
318 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
318 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 
318 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 
318 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
318 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
321 aa  209  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
327 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
327 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.772391  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
328 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00290712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
332 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  36.92 
 
 
321 aa  207  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
315 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  35.98 
 
 
318 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.98 
 
 
318 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.98 
 
 
318 aa  205  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
321 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
336 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111157 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
321 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
328 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687314  normal  0.260687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
329 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
331 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00166089  hitchhiker  0.0087818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
351 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14290  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.44 
 
 
329 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 
307 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  36 
 
 
321 aa  197  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
321 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  35.65 
 
 
307 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
307 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  38.08 
 
 
324 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
315 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
322 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
325 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
328 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.0366433 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
319 aa  192  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
321 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
327 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000273599  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
327 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0910485  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
313 aa  190  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0569  oligopeptide ABC transporter, permease  34.25 
 
 
321 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.94 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
322 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  34.69 
 
 
351 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
327 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000370081  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
315 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
316 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5699  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.33 
 
 
327 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0252968  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0776  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.89 
 
 
320 aa  187  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429836  hitchhiker  0.000000000000473305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
322 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 
316 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  31.48 
 
 
316 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  34.3 
 
 
339 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  34.3 
 
 
339 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
325 aa  186  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
324 aa  186  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
328 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.111848  normal  0.36544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
328 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2949  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  31.17 
 
 
316 aa  185  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
326 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.45 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.42 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
320 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5516  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  34.73 
 
 
328 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  33.72 
 
 
339 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 
339 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  33.82 
 
 
339 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
319 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
339 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
326 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  33.82 
 
 
339 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  33.43 
 
 
339 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  33.43 
 
 
339 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  33.43 
 
 
339 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  33.43 
 
 
339 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  33.43 
 
 
339 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  33.43 
 
 
339 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>