More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1683 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
327 aa  645    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0910485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
327 aa  645    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000273599  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 
327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000370081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.16 
 
 
328 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.16 
 
 
328 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.45 
 
 
329 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.45 
 
 
328 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00209232  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5699  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  53.99 
 
 
327 aa  381  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0252968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14290  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  54.43 
 
 
329 aa  378  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.96 
 
 
330 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5516  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  55.18 
 
 
328 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.4 
 
 
328 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.0366433 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.49 
 
 
328 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00290712 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.49 
 
 
328 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687314  normal  0.260687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.27 
 
 
333 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.66 
 
 
332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.155681 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.27 
 
 
332 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.949619  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.74 
 
 
332 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66552  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.52 
 
 
330 aa  342  7e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3929  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  52.29 
 
 
332 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.15 
 
 
327 aa  328  6e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.15 
 
 
327 aa  317  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.53 
 
 
322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.161485  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.24 
 
 
327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.772391  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.51 
 
 
341 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0256159  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.81 
 
 
341 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.09 
 
 
322 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.6 
 
 
328 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.111848  normal  0.36544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.57 
 
 
338 aa  291  9e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285608  normal  0.325568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.6 
 
 
328 aa  289  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2949  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 
342 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.400561 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
323 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6876  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
335 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0537311  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
335 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5118  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide )  39.04 
 
 
337 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296521  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
321 aa  228  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4141  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
337 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633745 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
321 aa  222  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
321 aa  222  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00111488  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
358 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
321 aa  215  9e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
328 aa  205  8e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000323084  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
332 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00733957  hitchhiker  0.00049009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  35.89 
 
 
348 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.28 
 
 
345 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  34.45 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.45 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
351 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 
318 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
349 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
349 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  hitchhiker  0.0000268959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 
318 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
326 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
353 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  34.45 
 
 
318 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 
321 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 
318 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  34.35 
 
 
321 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
321 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
321 aa  189  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
322 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
322 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.44 
 
 
333 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
316 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
318 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0569  oligopeptide ABC transporter, permease  33.23 
 
 
321 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
319 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  33.75 
 
 
307 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 
307 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
318 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
319 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
322 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
319 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
307 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
336 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
326 aa  178  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.545551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
319 aa  178  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
321 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
322 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0726  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0625  oligopeptide ABC transporter permease  32.73 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0895389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0568  oligopeptide ABC transporter, permease  32.73 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0658  oligopeptide ABC transporter permease protein  32.73 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.975917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0787  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0715  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000364541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 
316 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
306 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
320 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>