More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5115 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5115  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
189 aa  362  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2433  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  67.38 
 
 
191 aa  256  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0996  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.22 
 
 
189 aa  220  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.643344  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0524  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  58.92 
 
 
192 aa  218  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1119  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.38 
 
 
188 aa  208  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.628866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2056  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.69 
 
 
193 aa  206  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1097  hypothetical protein  53.76 
 
 
197 aa  185  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.177392 
 
 
-
 
NC_002950  PG0224  hypothetical protein  46.24 
 
 
212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02065  putative transmembrane protein  51.08 
 
 
193 aa  162  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808084  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  30.6 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.44 
 
 
219 aa  91.7  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.02 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  29.7 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.65 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  29.23 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.23 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.23 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  29.23 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.23 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.23 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.23 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.23 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.23 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0561  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.53 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.143657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  30.69 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1251  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.02 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000866197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.95 
 
 
212 aa  80.9  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.79 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  33.16 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1228  membrane transporter, MarC family  31.21 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.28 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  30.16 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  30.16 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.14 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.14 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.37 
 
 
217 aa  77.8  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  29.63 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  28.92 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.41 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  27.45 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.48 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.8 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.21 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.65 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  28.49 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  24.15 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  27.94 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  27.94 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.62 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  27.94 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  27.94 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  27.94 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2597  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.91 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370688  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  28.33 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0442  hypothetical protein  35.48 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  28.22 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.8 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.76 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4649  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.45 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.62 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.41 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  27.27 
 
 
216 aa  72  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4111  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.63 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.779903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  26.56 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  27.23 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0140  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.63 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.27 
 
 
218 aa  72  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  27.23 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  29.9 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2070  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.6 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  27.36 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.36 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  27.36 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  27.36 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  27.36 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  27.36 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  27.36 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.41 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.41 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.41 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.41 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.9 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1185  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.68 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  29.35 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.88 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.22 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.7 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.75 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  29.35 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.9 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.9 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4015  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.28 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.18 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.43 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.8 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.04 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0040  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  23.81 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0101018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.48 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2864  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.38 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.83 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>