More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4440 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4440  CBS domain containing protein  100 
 
 		 438 aa  898    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5985  gliding motility-associated protein GldE  51.57 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  34.39 
 
 		 431 aa  245  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0935  CBS domain containing protein  32.05 
 
 		 464 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3684  hemolysin-like protein  46.81 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  33.57 
 
 		 418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  43.83 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  35.92 
 
 		 421 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  31.57 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  35.82 
 
 		 447 aa  173  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  31.02 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  27.9 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  34.35 
 
 		 287 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  40.72 
 
 		 443 aa  170  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  31.18 
 
 		 430 aa  170  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  34.35 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  30.96 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  35.57 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  40.51 
 
 		 291 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  35.04 
 
 		 258 aa  163  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 		 291 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  39.24 
 
 		 291 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  39.24 
 
 		 291 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  39.24 
 
 		 291 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  35.86 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  39.24 
 
 		 291 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  35.17 
 
 		 296 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  37.72 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  40.08 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  39.24 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  39.24 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  37.72 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  37.77 
 
 		 285 aa  160  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.24 
 
 		 292 aa  160  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  38.82 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.66 
 
 		 299 aa  159  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  35.59 
 
 		 259 aa  159  9e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.24 
 
 		 291 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3952  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173559 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  39.13 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  33.41 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  38.79 
 
 		 293 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  31.63 
 
 		 444 aa  156  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  38.93 
 
 		 292 aa  156  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  29.15 
 
 		 427 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  34.17 
 
 		 425 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  28.61 
 
 		 432 aa  156  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  36.48 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  31.29 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  27.64 
 
 		 454 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  34.73 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  38.4 
 
 		 291 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  39.76 
 
 		 448 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  35.53 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  37.74 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  37.55 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  38.53 
 
 		 285 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  37.83 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  35.65 
 
 		 284 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  35.43 
 
 		 273 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  28.12 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 		 286 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  28.12 
 
 		 445 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  37.12 
 
 		 292 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  35.09 
 
 		 440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  40.26 
 
 		 297 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 		 292 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  37.77 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  34.02 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  36.03 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  37.07 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.69 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  36.03 
 
 		 291 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0821  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.57 
 
 		 292 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  36.99 
 
 		 273 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  33.91 
 
 		 445 aa  146  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  30.3 
 
 		 420 aa  146  6e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  27.99 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  34.02 
 
 		 433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  28.37 
 
 		 430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0993  hemolysin  40.26 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0803506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  34 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  29.89 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2918  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.83 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  38.6 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1833  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.83 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  36.99 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3008  transporter-associated region  39.83 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.983177  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  36.4 
 
 		 279 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  37.93 
 
 		 291 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  33.88 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.69 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1565  transporter-associated region  36.48 
 
 		 284 aa  144  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  35.53 
 
 		 250 aa  144  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  32.66 
 
 		 284 aa  143  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 275 aa  144  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2968  transporter-associated region  39.15 
 
 		 292 aa  143  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.386789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0589  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.15 
 
 		 292 aa  143  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.315177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>