More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0935 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0935  CBS domain containing protein  100 
 
 
464 aa  946    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  40.05 
 
 
431 aa  347  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  37.62 
 
 
431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  34.05 
 
 
418 aa  301  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5985  gliding motility-associated protein GldE  39.71 
 
 
453 aa  293  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  34.63 
 
 
419 aa  268  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4440  CBS domain containing protein  32.05 
 
 
438 aa  242  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3684  hemolysin-like protein  40.08 
 
 
293 aa  217  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335201  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  32.45 
 
 
421 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  31.37 
 
 
434 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  27.85 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  28.54 
 
 
454 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  29.53 
 
 
436 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  29.13 
 
 
434 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  28.22 
 
 
420 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  29.46 
 
 
421 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  29.46 
 
 
421 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  29.07 
 
 
436 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  31.03 
 
 
433 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  29.88 
 
 
423 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  28.02 
 
 
434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  25.77 
 
 
417 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
427 aa  171  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  28.81 
 
 
440 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  35.07 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  35.5 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  29.49 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  30.9 
 
 
443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.21 
 
 
430 aa  163  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  26.7 
 
 
464 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  27.17 
 
 
429 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  26.29 
 
 
464 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  27.51 
 
 
435 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  26.72 
 
 
465 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  33.19 
 
 
447 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  28.14 
 
 
439 aa  161  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  25.79 
 
 
464 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  26.55 
 
 
429 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  27.63 
 
 
468 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  27.7 
 
 
432 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  27.68 
 
 
467 aa  159  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  32.08 
 
 
258 aa  159  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  26.9 
 
 
447 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  27.65 
 
 
431 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  28.33 
 
 
431 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  27.34 
 
 
434 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  26.35 
 
 
436 aa  157  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  27.66 
 
 
477 aa  156  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  32.46 
 
 
284 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  28.12 
 
 
433 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  25.37 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  28.08 
 
 
442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.15 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  27.86 
 
 
523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  26.51 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  30.15 
 
 
445 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  25.98 
 
 
429 aa  153  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  28.43 
 
 
429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  25.99 
 
 
442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  30.88 
 
 
296 aa  153  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  26.51 
 
 
427 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  36.8 
 
 
285 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  25.93 
 
 
442 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  25.93 
 
 
442 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  27.19 
 
 
446 aa  151  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  35 
 
 
259 aa  150  3e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  28.23 
 
 
439 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  28.41 
 
 
421 aa  150  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  25.94 
 
 
414 aa  150  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  27.97 
 
 
426 aa  149  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  32.16 
 
 
455 aa  149  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  34.09 
 
 
298 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  30.56 
 
 
424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  35.23 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  28.03 
 
 
487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  25.55 
 
 
479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  26.27 
 
 
417 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  26.53 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  35.5 
 
 
273 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  28.64 
 
 
433 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  35.11 
 
 
275 aa  148  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  32.34 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  36.71 
 
 
438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  27.61 
 
 
470 aa  147  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  27.72 
 
 
425 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 
250 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  26.22 
 
 
444 aa  146  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  24.42 
 
 
432 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  26.98 
 
 
439 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  33.62 
 
 
430 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  26.92 
 
 
438 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  26.23 
 
 
456 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  26.39 
 
 
444 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  24.42 
 
 
428 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0376  CBS domain containing protein  24.46 
 
 
404 aa  144  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  34.4 
 
 
285 aa  144  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  26.45 
 
 
464 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  27.47 
 
 
443 aa  144  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  24.64 
 
 
424 aa  143  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  30.5 
 
 
284 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>