More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3119 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 463 aa  949    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  67.47 
 
 		 470 aa  654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  67.03 
 
 		 466 aa  654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  65 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  64.29 
 
 		 470 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  64.92 
 
 		 471 aa  609  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  61.66 
 
 		 471 aa  603  1.0000000000000001e-171  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  60.04 
 
 		 470 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.9 
 
 		 472 aa  542  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  55.53 
 
 		 471 aa  540  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  52.75 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  44.08 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  44.08 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  42.32 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  42.32 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  42.32 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  40.43 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  41.23 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  40.87 
 
 		 461 aa  323  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  39.66 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  38.05 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  38.85 
 
 		 455 aa  297  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  37.24 
 
 		 480 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  36.76 
 
 		 480 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  36.91 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 		 476 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  39.39 
 
 		 456 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  34.13 
 
 		 617 aa  270  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  34.75 
 
 		 469 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 		 471 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  34.63 
 
 		 478 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  34.63 
 
 		 484 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  34.63 
 
 		 484 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.43 
 
 		 478 aa  255  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.63 
 
 		 478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  35.33 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.43 
 
 		 478 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.47 
 
 		 478 aa  251  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 		 466 aa  249  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 		 470 aa  246  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  33.56 
 
 		 442 aa  246  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  33.9 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 		 450 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.04 
 
 		 456 aa  230  5e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  34.16 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  33.62 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  32.51 
 
 		 448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.81 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  33.26 
 
 		 450 aa  221  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  35.41 
 
 		 453 aa  219  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 		 476 aa  219  7e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  31.25 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 		 470 aa  216  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  35.32 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 		 455 aa  213  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 464 aa  211  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 		 462 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  30.77 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 		 450 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32.07 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 471 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.12 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.9 
 
 		 453 aa  187  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 		 488 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 489 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 452 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 451 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  27.25 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 470 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  30.13 
 
 		 446 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 		 246 aa  143  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  42.7 
 
 		 244 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  38.68 
 
 		 251 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  36.86 
 
 		 244 aa  139  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 		 243 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  36.76 
 
 		 390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 243 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 		 375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  37.75 
 
 		 243 aa  130  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  36.72 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 243 aa  123  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  32.85 
 
 		 397 aa  123  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  34.89 
 
 		 397 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2641  beta-lactamase domain protein  40.97 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>