More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2164 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2164  ABC transporter transmembrane region  100 
 
 		 585 aa  1181    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2232  ABC transporter related  68.77 
 
 		 586 aa  808    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1095  ABC transporter related protein  64.57 
 
 		 587 aa  756    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850281  normal  0.198173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3308  ABC transporter related  62.16 
 
 		 586 aa  713    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682367  hitchhiker  0.0000512121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.96 
 
 		 614 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  34.36 
 
 		 594 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.57 
 
 		 597 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  34.9 
 
 		 620 aa  312  9e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  34.64 
 
 		 620 aa  310  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  32.58 
 
 		 594 aa  310  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.21 
 
 		 607 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  32.64 
 
 		 600 aa  309  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.57 
 
 		 597 aa  309  9e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.43 
 
 		 608 aa  309  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.57 
 
 		 597 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  32.44 
 
 		 598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.09 
 
 		 617 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.62 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  31.2 
 
 		 622 aa  296  8e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  34.5 
 
 		 609 aa  295  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.25 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.51 
 
 		 589 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.6 
 
 		 598 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.88 
 
 		 598 aa  290  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  32.36 
 
 		 605 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  31.55 
 
 		 637 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.83 
 
 		 598 aa  281  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.64 
 
 		 598 aa  280  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  32.64 
 
 		 598 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.64 
 
 		 598 aa  280  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.64 
 
 		 598 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  32.07 
 
 		 598 aa  280  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  32.04 
 
 		 611 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  30.28 
 
 		 614 aa  277  4e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  30.6 
 
 		 600 aa  277  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  30.41 
 
 		 606 aa  277  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  32.67 
 
 		 602 aa  276  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  28.9 
 
 		 618 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  30.73 
 
 		 594 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  31.98 
 
 		 602 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  31.13 
 
 		 607 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  30.24 
 
 		 634 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  29.63 
 
 		 635 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  31.78 
 
 		 632 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  30.9 
 
 		 632 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  31.42 
 
 		 600 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  32.87 
 
 		 636 aa  273  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  31.11 
 
 		 615 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  30.88 
 
 		 602 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  30.94 
 
 		 625 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.04 
 
 		 566 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  31.46 
 
 		 611 aa  270  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  30 
 
 		 589 aa  270  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  32.2 
 
 		 666 aa  270  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  32.16 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  27.91 
 
 		 607 aa  270  5.9999999999999995e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.63 
 
 		 566 aa  270  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  28.8 
 
 		 576 aa  269  8e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  29.58 
 
 		 675 aa  269  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  31.14 
 
 		 592 aa  269  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  30.07 
 
 		 614 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.15 
 
 		 702 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.31 
 
 		 586 aa  267  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.61 
 
 		 556 aa  267  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  31.68 
 
 		 733 aa  267  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.44 
 
 		 615 aa  266  8e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  29.25 
 
 		 587 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  32.14 
 
 		 608 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  29.85 
 
 		 628 aa  265  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  29.77 
 
 		 587 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  30.89 
 
 		 587 aa  264  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  30.89 
 
 		 587 aa  264  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.97 
 
 		 586 aa  264  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  30.89 
 
 		 587 aa  264  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.89 
 
 		 587 aa  264  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.89 
 
 		 587 aa  264  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  30.04 
 
 		 611 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  30.81 
 
 		 616 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  29.77 
 
 		 631 aa  263  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  29.45 
 
 		 610 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.89 
 
 		 587 aa  263  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  29.59 
 
 		 587 aa  263  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  29.79 
 
 		 602 aa  263  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  32.54 
 
 		 782 aa  263  8.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  30.54 
 
 		 669 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  30.53 
 
 		 592 aa  262  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.74 
 
 		 632 aa  262  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.14 
 
 		 586 aa  262  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.09 
 
 		 608 aa  262  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.14 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.37 
 
 		 721 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.78 
 
 		 587 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  31.23 
 
 		 631 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  30.16 
 
 		 582 aa  261  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.14 
 
 		 586 aa  261  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  31.03 
 
 		 631 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  28.85 
 
 		 590 aa  261  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  32.32 
 
 		 642 aa  261  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  29.38 
 
 		 603 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>