More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1610 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  100 
 
 
274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  74.35 
 
 
270 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  73.72 
 
 
280 aa  418  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  38.2 
 
 
277 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  37.22 
 
 
276 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  36.88 
 
 
279 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  35.21 
 
 
277 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  36.74 
 
 
279 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.95 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  33.21 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
250 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  33.21 
 
 
252 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  34.08 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.71 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 
266 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  32.72 
 
 
286 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  35.32 
 
 
273 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
274 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  34.94 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
275 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
275 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  34.08 
 
 
286 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  33.83 
 
 
284 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  33.19 
 
 
274 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
273 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  32.51 
 
 
274 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  33.09 
 
 
278 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 
266 aa  99  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.14 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  37.08 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  28.62 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
275 aa  88.6  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  37.59 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  39.17 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  39.17 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  39.17 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  40.52 
 
 
581 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  39.02 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  28.35 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.7 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.79 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.88 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  33.16 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.4 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  36.03 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.13 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  38.94 
 
 
637 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  40 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.65 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  35.14 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 
226 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.14 
 
 
204 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
225 aa  63.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.14 
 
 
204 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  39.64 
 
 
280 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 
234 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  29.04 
 
 
281 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
224 aa  62  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  31.28 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
415 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  27.71 
 
 
313 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  26.59 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.96 
 
 
234 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.91 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.91 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.29 
 
 
204 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
202 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.58 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.07 
 
 
256 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  32.5 
 
 
377 aa  59.3  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  34.58 
 
 
240 aa  58.9  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
226 aa  58.9  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
257 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>