151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2000 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2000  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 		 512 aa  1056    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  43.24 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  43.65 
 
 		 507 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  42.61 
 
 		 523 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1620  flagellar hook-associated protein 3  35.73 
 
 		 497 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  36.73 
 
 		 594 aa  176  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  35.46 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  35.25 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  27.98 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  30.91 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  30.82 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  29.53 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  32.61 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  30.71 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  31.29 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  30.07 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  30.99 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  30.94 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  28.99 
 
 		 298 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  28.31 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  30.2 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  30.43 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  33.58 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  31.54 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  28.19 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  31.91 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  28.86 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  30.92 
 
 		 870 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  31.76 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  30.2 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  31.51 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  29.34 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  29.2 
 
 		 1008 aa  62.4  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  36.04 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  34.62 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  27.86 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  26.53 
 
 		 298 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0080  flagellin-like protein  25.66 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  26.24 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  28.24 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0790  flagellin domain-containing protein  31.21 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.585349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  25.67 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  27.89 
 
 		 524 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1638  flagellin domain-containing protein  29.76 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.588406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  26.62 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  27.21 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  26.03 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  27.97 
 
 		 402 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  24.29 
 
 		 298 aa  56.6  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2950  flagellin domain protein  35.24 
 
 		 296 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  29.5 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  27.59 
 
 		 514 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  30.15 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  27.42 
 
 		 295 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  29.5 
 
 		 309 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1622  flagellin domain protein  33.04 
 
 		 295 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  29.61 
 
 		 311 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  26.32 
 
 		 416 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  28.87 
 
 		 303 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2282  flagellin domain protein  31.11 
 
 		 295 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.581446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  27.66 
 
 		 402 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  26.62 
 
 		 405 aa  54.3  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  25.48 
 
 		 530 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  29.5 
 
 		 309 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  25.5 
 
 		 297 aa  53.5  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  27.21 
 
 		 305 aa  53.5  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2280  flagellin domain protein  31.11 
 
 		 295 aa  53.5  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0209  flagellar hook-associated protein 3  31.3 
 
 		 301 aa  53.5  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0786  flagellin domain protein  33.02 
 
 		 295 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.130043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  29.82 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  27.52 
 
 		 312 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  30.5 
 
 		 317 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  28 
 
 		 317 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  29.79 
 
 		 317 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1028  flagellin domain protein  29.63 
 
 		 302 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  29.79 
 
 		 317 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  27.66 
 
 		 521 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1502  flagellin  29.08 
 
 		 297 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0182  flagellar hook-associated protein FlgL  26.43 
 
 		 424 aa  52  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  29.79 
 
 		 317 aa  52  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  29.79 
 
 		 317 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  26.85 
 
 		 305 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  29.79 
 
 		 317 aa  52  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  30.34 
 
 		 318 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  29.79 
 
 		 317 aa  52  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1501  flagellin  34.29 
 
 		 297 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.888195  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1147  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.271109  normal  0.29908 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  26.62 
 
 		 300 aa  51.2  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  26.06 
 
 		 532 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  22.8 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  25.18 
 
 		 403 aa  50.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  25.87 
 
 		 403 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  25.87 
 
 		 403 aa  50.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>