183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1878 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
318 aa  645    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  81.59 
 
 
317 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  55.17 
 
 
319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  54.15 
 
 
326 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  54.15 
 
 
326 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  56.43 
 
 
309 aa  348  8e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  54.06 
 
 
317 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  54.06 
 
 
317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  54.06 
 
 
317 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  53.75 
 
 
317 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  54.37 
 
 
317 aa  338  7e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  53.75 
 
 
317 aa  336  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  53.75 
 
 
317 aa  335  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  53.44 
 
 
317 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  53.12 
 
 
317 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  53.12 
 
 
317 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  53.12 
 
 
317 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  53.12 
 
 
317 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  53.12 
 
 
317 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  50.31 
 
 
317 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  53.63 
 
 
248 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  38.23 
 
 
312 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  35.31 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  34.17 
 
 
302 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  33.75 
 
 
311 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  32.06 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  42.63 
 
 
412 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  40.84 
 
 
401 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  39.04 
 
 
410 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  37.37 
 
 
404 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  36.22 
 
 
406 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  26.55 
 
 
326 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  35.08 
 
 
403 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  33.15 
 
 
433 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4781  flagellar hook-associated protein 3  28.44 
 
 
319 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.892762  normal  0.741415 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3704  flagellar hook-associated protein 3  28.44 
 
 
319 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218733  normal  0.125395 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  36.3 
 
 
404 aa  99  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  26.73 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  36.71 
 
 
411 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  36.71 
 
 
411 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  36.71 
 
 
411 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  34.97 
 
 
439 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  31.69 
 
 
410 aa  92.8  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  32.98 
 
 
562 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
407 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
410 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
407 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  36.59 
 
 
396 aa  89.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  34.16 
 
 
400 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  31.18 
 
 
416 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  33.74 
 
 
401 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
413 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  27.54 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
413 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  32.54 
 
 
396 aa  87.4  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
411 aa  86.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  31.15 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  31.72 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  34.18 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  34.9 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  34.9 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  31.96 
 
 
524 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  26.43 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  28.43 
 
 
521 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  32.93 
 
 
523 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  30.27 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  29.61 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  32.16 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  35.1 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  30.6 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  23.77 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  29.95 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  34.39 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  30.63 
 
 
530 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  25.96 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  30.05 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  34.16 
 
 
521 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  24.15 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  28.42 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  28.72 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  0.00000747775 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  28.42 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  32.21 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  22.19 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  32.21 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  33.12 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  30.27 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  30.27 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  32.21 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  29.05 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  31.21 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 
530 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>