58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0080 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0080  flagellin-like protein  100 
 
 
401 aa  804    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.108772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  25.68 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  24.83 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2000  flagellar hook-associated protein 3  25.66 
 
 
512 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  29.17 
 
 
305 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  31.11 
 
 
305 aa  57  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  28.38 
 
 
420 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  32.61 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  27.92 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  28.86 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  27.7 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  29.17 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  26.63 
 
 
298 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  26.86 
 
 
298 aa  53.5  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  24.83 
 
 
532 aa  53.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  25.34 
 
 
594 aa  53.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  26.09 
 
 
297 aa  53.1  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  26.92 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  26.21 
 
 
305 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  22.54 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  27.45 
 
 
411 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  23.4 
 
 
523 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  22.88 
 
 
297 aa  49.7  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  27.45 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  26.12 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  28.1 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  23.61 
 
 
315 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  21.38 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  24.35 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  27.08 
 
 
396 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  30.07 
 
 
305 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  26.53 
 
 
301 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  28.66 
 
 
296 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  28.57 
 
 
438 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  30.38 
 
 
404 aa  46.6  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  22.15 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  24.67 
 
 
296 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  28.67 
 
 
305 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  26.35 
 
 
305 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  20.81 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  22.36 
 
 
504 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  22.86 
 
 
507 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  20.24 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  24.39 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  21.27 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  25.68 
 
 
305 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  25.28 
 
 
408 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  25.95 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  26.21 
 
 
328 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  26.71 
 
 
310 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  26.19 
 
 
396 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  25.34 
 
 
319 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  23.08 
 
 
309 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  25.33 
 
 
401 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  24.52 
 
 
402 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  24.5 
 
 
523 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  25.17 
 
 
412 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  26.17 
 
 
428 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>