168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0529 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0529  flagellar protein FliS  100 
 
 
248 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  55.35 
 
 
301 aa  175  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  55.7 
 
 
286 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  59.85 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  50.85 
 
 
136 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  36.07 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  42.61 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  42.15 
 
 
144 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  42 
 
 
135 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  33.88 
 
 
140 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  43 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  37.39 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  39.2 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  45 
 
 
129 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  38.84 
 
 
136 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  42 
 
 
132 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  42 
 
 
132 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  38.74 
 
 
134 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  34.71 
 
 
139 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  41.9 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  43 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  31.97 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  41 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  41 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  40 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  41 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  41 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  41 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  36.75 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  38.54 
 
 
130 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  36.36 
 
 
148 aa  72  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  36 
 
 
138 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  37.37 
 
 
136 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  37.37 
 
 
136 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  32.79 
 
 
136 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  37.5 
 
 
130 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  36.89 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  31.15 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  41 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  28.69 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  36.04 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  40.4 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  41.05 
 
 
133 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
137 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  35.35 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  37.7 
 
 
144 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  37.88 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  35.88 
 
 
137 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  33.93 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  33.06 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  32.73 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  36.79 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0177  flagellar protein FliS  33.94 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.711098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  37 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  36 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  31.82 
 
 
136 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  32.8 
 
 
136 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  35.82 
 
 
144 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  32.8 
 
 
136 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0229  flagellar protein FliS  33.03 
 
 
128 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  29.69 
 
 
137 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  35.07 
 
 
144 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  29.69 
 
 
137 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  32.8 
 
 
136 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  34.38 
 
 
128 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  32.8 
 
 
136 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  32.8 
 
 
136 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  32.8 
 
 
136 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  31.25 
 
 
133 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  39 
 
 
132 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  32.11 
 
 
133 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  31.31 
 
 
126 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  31.82 
 
 
134 aa  63.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.05 
 
 
134 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  35.37 
 
 
168 aa  62.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  38.52 
 
 
144 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3081  flagellar protein FliS  38.52 
 
 
144 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  38.52 
 
 
144 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  32 
 
 
136 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  34.17 
 
 
139 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  29.75 
 
 
139 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  34.55 
 
 
133 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  29.09 
 
 
136 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  29.09 
 
 
136 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  33.6 
 
 
137 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  31.4 
 
 
152 aa  59.3  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  35.19 
 
 
138 aa  58.9  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  33.33 
 
 
128 aa  58.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  36.15 
 
 
144 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
145 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0656  flagellar protein FliS  35.87 
 
 
127 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  32.32 
 
 
129 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3463  flagellar protein FliS  38 
 
 
129 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.220279  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  33.98 
 
 
132 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4164  flagellar protein FliS  35.29 
 
 
140 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  30.33 
 
 
141 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  31.82 
 
 
136 aa  57.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>