More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3080 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  100 
 
 		 309 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  75.49 
 
 		 310 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  71.43 
 
 		 308 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  62.78 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  63.43 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  61.26 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  61.11 
 
 		 318 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  58.5 
 
 		 311 aa  358  6e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  57.05 
 
 		 307 aa  357  9.999999999999999e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  64.45 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  57.43 
 
 		 312 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  56.39 
 
 		 307 aa  354  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  58.82 
 
 		 311 aa  352  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  60.39 
 
 		 308 aa  349  4e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  59.15 
 
 		 310 aa  348  6e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  56.72 
 
 		 304 aa  348  8e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  59.28 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  61.64 
 
 		 309 aa  346  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  61.89 
 
 		 309 aa  346  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  55.92 
 
 		 312 aa  345  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  56.54 
 
 		 311 aa  345  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  59.48 
 
 		 310 aa  345  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  57.65 
 
 		 327 aa  342  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  60.98 
 
 		 309 aa  341  9e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  60.46 
 
 		 310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  57.89 
 
 		 308 aa  339  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  58.69 
 
 		 309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  63.28 
 
 		 309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  57.65 
 
 		 309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  60.98 
 
 		 314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  58.31 
 
 		 309 aa  335  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  54.1 
 
 		 304 aa  335  3.9999999999999995e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  59.29 
 
 		 322 aa  335  5.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  60 
 
 		 311 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  58.22 
 
 		 311 aa  334  9e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  60 
 
 		 311 aa  334  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  60.78 
 
 		 311 aa  334  9e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  57.7 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  58.17 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  57.7 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  57.14 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  61.2 
 
 		 327 aa  332  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  53.55 
 
 		 310 aa  332  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  56.25 
 
 		 311 aa  330  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  57.38 
 
 		 309 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  55.08 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  61.76 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  56.72 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 328 aa  329  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  59.53 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  57.57 
 
 		 311 aa  329  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  56.77 
 
 		 311 aa  328  5.0000000000000004e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  56.33 
 
 		 320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  61.76 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  59.61 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  58.69 
 
 		 316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  60.87 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  56.39 
 
 		 308 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  58.03 
 
 		 308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  55.37 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  59.93 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  59.87 
 
 		 326 aa  326  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  59.87 
 
 		 326 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  57 
 
 		 311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  59.34 
 
 		 311 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  58.88 
 
 		 311 aa  325  7e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  56.72 
 
 		 310 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  55.56 
 
 		 317 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  59.2 
 
 		 325 aa  324  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  54.87 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  56.07 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  55.7 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  56.86 
 
 		 317 aa  323  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  56.21 
 
 		 339 aa  321  8e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  56.91 
 
 		 308 aa  321  9.000000000000001e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  56.49 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  57.98 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  56.25 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  56.21 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  58.92 
 
 		 307 aa  319  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  57.93 
 
 		 319 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26311  O-acetylserine (thiol)-lyase A  58.01 
 
 		 328 aa  319  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  58.92 
 
 		 307 aa  318  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  54.37 
 
 		 317 aa  318  7.999999999999999e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  56.03 
 
 		 327 aa  318  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  59.8 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  57.79 
 
 		 329 aa  317  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  54.33 
 
 		 320 aa  317  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  54.82 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  52.51 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  53.59 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0325  cysteine synthase K/M/A  59.22 
 
 		 322 aa  315  6e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26961  O-acetylserinethiol lyase/cysteine synthase  58.22 
 
 		 305 aa  315  6e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  58.96 
 
 		 332 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  56.91 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  54.82 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  56.41 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  57.61 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  50.66 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  50.66 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>