More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1202 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1202  thioredoxin, putative  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267442  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0464  thioredoxin, putative  47.83 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.973322  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2555  glutaredoxin  48.81 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  32 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  31.25 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  29.47 
 
 		 259 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  34.02 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  30.61 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  30.3 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  32 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  29.7 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  31.63 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  31.96 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  31 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  32.29 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  32.35 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  31.37 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  28.57 
 
 		 259 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  31.68 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  30.93 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  30.61 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  29.59 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  34.62 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  31 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  34.07 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  28 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  28.71 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  28 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  28.74 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  36.46 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  36.46 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  31.68 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  30.93 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  30 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  29 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  33.71 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  27.47 
 
 		 257 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  26.26 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  25.53 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  26.83 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  26.73 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  31.25 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  27.72 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  26.73 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0760  ribosomal protein L12E/L44/L45/RPP1/RPP2-like protein  26.09 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.511664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  28.09 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  34.38 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  31.31 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  25.53 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  29.59 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  27.55 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  30.69 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf029  thioredoxin family member  27.27 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  29.41 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0227  thioredoxin-related  29.47 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2252  glutaredoxin 2  32.94 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.390766 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  27.17 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  27.08 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  29.41 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  28.12 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  31.31 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  29.7 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  27.78 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.15 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  31.82 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  29.7 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>