More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0843 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
321 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 
320 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.27 
 
 
312 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 
333 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
318 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.56 
 
 
295 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  35.55 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
310 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
316 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
313 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
318 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
321 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
314 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
597 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
310 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
357 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 
302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  32.37 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
351 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  34.72 
 
 
318 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  35.93 
 
 
300 aa  126  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  37.56 
 
 
380 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
303 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 
335 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
398 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
1250 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
704 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  36.64 
 
 
450 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 
327 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 
373 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
347 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
344 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
337 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
276 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
324 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
235 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1074  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.94 
 
 
236 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
581 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
1035 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.98 
 
 
312 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
847 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
305 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 
327 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
351 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  36.45 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
277 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
290 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
357 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
334 aa  113  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
274 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
333 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
334 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.91 
 
 
367 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 
672 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
727 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  32.37 
 
 
255 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  35.49 
 
 
362 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
352 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
233 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
374 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  32.44 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
930 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
390 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
349 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
209 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
323 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>