285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0468 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2863  CoA-binding domain-containing protein  56.52 
 
 
811 aa  921    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0468  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
820 aa  1660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3164  CoA-binding domain-containing protein  72.47 
 
 
800 aa  1196    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2367  CoA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 
797 aa  902    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2560  CoA-binding domain-containing protein  72.05 
 
 
803 aa  1186    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2968  organic acid-CoA ligase (ADP forming)  46.01 
 
 
696 aa  529  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939778  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0852  CoA-binding domain-containing protein  32.42 
 
 
732 aa  363  6e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0369796  hitchhiker  0.000048398 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1703  CoA-binding domain-containing protein  24.62 
 
 
680 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  24.87 
 
 
688 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4362  hypothetical protein  25.85 
 
 
709 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138782  normal  0.0457098 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  24.27 
 
 
705 aa  137  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  29.05 
 
 
707 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0319  CoA-binding domain protein  26.59 
 
 
464 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  24.37 
 
 
680 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1093  CoA-binding domain-containing protein  27.22 
 
 
477 aa  131  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  25.2 
 
 
703 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0586  CoA-binding domain-containing protein  25.59 
 
 
705 aa  129  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  24.8 
 
 
702 aa  127  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  25.67 
 
 
707 aa  126  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  24.89 
 
 
687 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  25 
 
 
702 aa  125  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4122  CoA-binding domain protein  26.73 
 
 
719 aa  125  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  23.94 
 
 
706 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3116  hypothetical protein  25 
 
 
713 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0277399  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.74 
 
 
699 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  25.19 
 
 
722 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  26.06 
 
 
689 aa  120  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0914  CoA-binding domain-containing protein  25.74 
 
 
687 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.216851  hitchhiker  0.00000000145434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  26.44 
 
 
707 aa  118  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1804  CoA-binding domain-containing protein  26.97 
 
 
461 aa  118  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.688194  normal  0.0833486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0162  CoA-binding domain-containing protein  28.07 
 
 
516 aa  117  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  24.57 
 
 
920 aa  118  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  24.94 
 
 
722 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0484  CoA-binding domain-containing protein  27.55 
 
 
461 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.833675  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0290  CoA-binding domain-containing protein  27.91 
 
 
461 aa  114  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.388357  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  30.58 
 
 
700 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.67 
 
 
929 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  27.66 
 
 
698 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1635  CoA-binding domain-containing protein  29.26 
 
 
461 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  29.32 
 
 
704 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  26.36 
 
 
911 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  22.51 
 
 
714 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  24.7 
 
 
711 aa  111  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  25.45 
 
 
696 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  25.93 
 
 
895 aa  110  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  26.98 
 
 
918 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  25.69 
 
 
697 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  26 
 
 
700 aa  109  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1620  CoA-binding domain-containing protein  26.33 
 
 
694 aa  109  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0696581 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1854  CoA-binding domain-containing protein  26.86 
 
 
472 aa  109  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  26.48 
 
 
698 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  26.48 
 
 
900 aa  109  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3442  CoA-binding domain protein  24.81 
 
 
710 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  27.81 
 
 
709 aa  109  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  25.4 
 
 
660 aa  107  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  27.21 
 
 
883 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  28.84 
 
 
660 aa  107  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  26.29 
 
 
903 aa  104  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  25.53 
 
 
915 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  29.72 
 
 
699 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  25.2 
 
 
892 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  25.06 
 
 
637 aa  103  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
907 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
899 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  27.35 
 
 
704 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  23.98 
 
 
905 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
907 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  27.38 
 
 
718 aa  101  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  26.08 
 
 
669 aa  101  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  28.2 
 
 
907 aa  101  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  25.88 
 
 
912 aa  101  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  25.18 
 
 
921 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4996  CoA-binding domain-containing protein  24.93 
 
 
705 aa  100  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  28.71 
 
 
709 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  24.75 
 
 
701 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1910  CoA-binding domain protein  26.29 
 
 
676 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236564  normal  0.164304 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  27.52 
 
 
741 aa  99.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  26.1 
 
 
897 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  27.98 
 
 
698 aa  98.6  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  28.83 
 
 
715 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  25.67 
 
 
913 aa  97.8  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.02 
 
 
699 aa  97.8  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  28.31 
 
 
715 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  27.34 
 
 
708 aa  95.5  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0336  CoA-binding domain-containing protein  26.87 
 
 
508 aa  95.9  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  26.21 
 
 
696 aa  95.5  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
897 aa  95.1  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  30.55 
 
 
703 aa  94.4  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2897  CoA-binding domain-containing protein  25.78 
 
 
451 aa  94  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  27.04 
 
 
700 aa  93.6  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  26.64 
 
 
706 aa  93.6  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  27.23 
 
 
712 aa  93.2  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1246  CoA-binding domain-containing protein  25.44 
 
 
753 aa  93.2  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000185124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  27.37 
 
 
711 aa  92.8  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  26.64 
 
 
728 aa  92.8  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  26.19 
 
 
705 aa  92.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  23.35 
 
 
712 aa  92  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1589  CoA-binding domain-containing protein  25.2 
 
 
451 aa  92  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  25.4 
 
 
750 aa  90.9  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  22.63 
 
 
896 aa  90.9  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>