39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3224 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 88 aa  181  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  84.71 
 
 		 85 aa  150  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  73.49 
 
 		 86 aa  130  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  67.05 
 
 		 93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  69.14 
 
 		 84 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  62.03 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  67.09 
 
 		 118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 96 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  53.25 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  50.65 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  50.65 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  45.88 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  47.89 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  42.31 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  42.31 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  45.95 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  43.42 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  52.54 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  40.24 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  36.21 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  38.46 
 
 		 347 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>