More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2440 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  72.12 
 
 		 260 aa  301  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  59.15 
 
 		 253 aa  254  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  58.22 
 
 		 253 aa  252  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  54.33 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  47.09 
 
 		 253 aa  204  6e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  51.3 
 
 		 267 aa  201  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  51.3 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  50.78 
 
 		 267 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  49.5 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  48.57 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  46.81 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  48.51 
 
 		 251 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  48.51 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  48.51 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  48.51 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  48.51 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  48.51 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  47.67 
 
 		 251 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  47.67 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  47.67 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  47.67 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  47.15 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  44.83 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  41.55 
 
 		 312 aa  154  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  36.11 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  39.44 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  38.79 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  37.19 
 
 		 275 aa  134  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  40 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 270 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  39.62 
 
 		 267 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  37.79 
 
 		 269 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  39.06 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  34.72 
 
 		 279 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  37.98 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  39.61 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  39.02 
 
 		 274 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  35.02 
 
 		 309 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  37.56 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  38.78 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  39.42 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  36.49 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  39.42 
 
 		 276 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  35.68 
 
 		 292 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35.85 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  37.44 
 
 		 275 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  35.68 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  34.17 
 
 		 307 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  35.12 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  37.2 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  37.38 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  33.49 
 
 		 558 aa  105  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  36.32 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  33.66 
 
 		 266 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  35.96 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  28.63 
 
 		 269 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  28.63 
 
 		 269 aa  101  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  37.21 
 
 		 290 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  37.67 
 
 		 291 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  34.93 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  28.51 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  35.29 
 
 		 295 aa  99.8  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  28.51 
 
 		 269 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  28.71 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  28.63 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  28.51 
 
 		 269 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  28.82 
 
 		 309 aa  95.9  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  28.49 
 
 		 249 aa  95.9  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  33.98 
 
 		 275 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 271 aa  95.5  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  34.45 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1477  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  33.97 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  32.67 
 
 		 269 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.6 
 
 		 269 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  27.6 
 
 		 269 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  27.6 
 
 		 269 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.6 
 
 		 269 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.6 
 
 		 269 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 315 aa  92.8  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  28.5 
 
 		 284 aa  92  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  28.5 
 
 		 284 aa  92  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 320 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  33.18 
 
 		 295 aa  89.4  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  31.16 
 
 		 325 aa  89  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  34.82 
 
 		 295 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1753  methyltransferase type 11  30.73 
 
 		 367 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 278 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  30.33 
 
 		 281 aa  86.3  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  33.79 
 
 		 294 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  29.86 
 
 		 281 aa  86.3  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1660  methyltransferase type 11  30.8 
 
 		 309 aa  85.1  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2525  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  29.26 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1797  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  24.77 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.77 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>