26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0168 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0168  O-antigen polymerase  100 
 
 		 400 aa  818    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  70.5 
 
 		 402 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  23.38 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.2 
 
 		 540 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4808  O-antigen polymerase  24.44 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1952  O-antigen polymerase  34.57 
 
 		 653 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.953343  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2290  O-antigen polymerase  28.71 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  28.08 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  32.26 
 
 		 503 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1889  O-antigen polymerase  32.84 
 
 		 494 aa  46.6  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818952  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  28.42 
 
 		 737 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  24.42 
 
 		 607 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  30 
 
 		 773 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  33.71 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  33.75 
 
 		 647 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  37.5 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  31.78 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  37.5 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0480  hypothetical protein  27.97 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  28 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  25 
 
 		 443 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  28 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  28 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  28 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2346  O-antigen polymerase  27.84 
 
 		 481 aa  43.1  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>