16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1889 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1889  O-antigen polymerase  100 
 
 
494 aa  964    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818952  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2346  O-antigen polymerase  29.76 
 
 
481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0249  O-antigen polymerase  30.95 
 
 
492 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  34.83 
 
 
358 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  23.5 
 
 
404 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  25 
 
 
404 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  25 
 
 
404 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  25 
 
 
404 aa  50.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  25 
 
 
404 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0891  O-antigen polymerase  30.34 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335212  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  28 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  26.85 
 
 
426 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  25.84 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  28.97 
 
 
438 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0168  O-antigen polymerase  33.9 
 
 
400 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  26.42 
 
 
737 aa  43.5  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>